她将朝政交还给献文帝拓跋弘，自己隐在宫中。拓跋弘也很喜欢这个儿子，在他2岁时便册为太子。但很快，献文帝便因为杀冯太后的亲信，引来冯太后不快。冯太后声威仍在，迫于压力，献文帝禅位，当了个太上皇，但他仍然不放手中之权。冯太后怎么可能允许他以太上皇身份继续掌控朝廷？公元476年的一天，9岁小皇帝拓跋宏突然收到消息：他父亲死了。
献文帝已经成了过去式，此刻的冯太后将重心放在辅佐孙子上。孝文帝拓跋宏虽然年幼，却相当聪颖，学习刻苦，一点就透，在冯氏的引导下，他遍览儒家学说、史传百家，修得治国之术，更难得的是，冯氏以身作则，教会了孝文帝要具备为政宽和之道，不可因为自身的喜乐，就任性使用手中权力。
某次厨师进膳，送上来的米粥中竟然有虫子，冯太后用汤匙将虫子拨出，在一旁侍奉祖母的孝文帝见状大怒，立刻就要对那厨师处以极刑。谁知，冯太后却宽容地笑了笑，她说：厨师未必是故意，你看他都吓得浑身发抖了，得饶人处且饶人，驭下，不可一昧用雷霆手段啊。
冯太后赦免了厨师罪过，这件事给孝文帝留下了很深印象。日后，他也遇到过类似事情，想起祖母的教诲，便饶恕了厨师仆役。孝文帝被后世评为“有舜、文王之姿”，绝大部分功劳要算在冯太后身上。
冯太后不仅影响着孝文帝，也影响着北魏方方面面，她进行了多方面改制，风俗方面去除鲜卑人一些不合理的习惯，经济政治方面，推行三长制、均田制，北魏昔日为宗主所藏的人口被释放创造社会财富，农民负担减轻，国库赋税收入增加，经济自然得到了发展，同时，皇权更加稳固，世家豪族力量被削弱。
她以非凡的智谋和权术平衡着北魏朝堂内外，孝文帝耳濡目染，学到不少，与祖母的感情也日渐加深。冯太后与女帝武则天的手腕都很高明，但她没有想过称帝；冯太后与慈禧都大权在握，但她没用这个东西为自己享乐服务，而是厉行节俭，她在北魏两任皇帝皆年幼的情况下挑起重任，稳住朝纲，无论是能力还是魄力，她都不输给任何一个男性帝王。
公元490年，孝文帝已长大成人，可独当一面，而冯太后完成了她的使命，崩逝太和殿，终年49岁。她将一生书写成传奇，为北魏奉献了自己所有的精力，更培养了一位优秀的继承者，使王朝安定，促成北魏皇权顺利交接，她不是只会谈情说爱的假女主，是真正的大女主。
