然而到了刘义隆时代，南北对峙已成定局，北魏已然统一了北方，之前五胡十六国时代北方大规模的战乱也没有之前那么频繁，所以京口的流民相对少了许多。
而刘义隆和刘裕不同，刘裕是靠着京口起家的，因此格外重视京口的战略价值，所用的兵将也大多是来自于京口的，而刘义隆不同，他是以荆州入主中枢的，京口并非他起家之地，因此对于京口并非格外重视，相反跟随他从荆州来的旧部在这之后都受到了重用，也因此由于刘义隆的忽视京口的兵员刘义隆也没有好好利用，北府军的没落是必然的。
所以到了刘义隆时期北府兵没落是必然的，人才凋零，北方战乱也不再那么频繁，南来之人也相对减少，而京口的战略价值又不为刘义隆重视，所以这支北府兵在刘裕时代短暂的辉煌之后就立即消失不见了。
