明孝陵处于山明水秀的环境之中，周围山势跌宕崎岖，山环水绕，人文与天然景观浑然天成。墓区的修建大体分为两大部分：榜首组神道部分，从下马坊起，到孝陵正门；第二组是主体部分，从正门到宝城、明楼、崇丘停止。
方城是孝陵宝顶前面的一座巨大修建，外部均用巨型条石建成，东西长75.26米，南北宽30.94米、前高16.25米、后高8.13米，底部为须弥座。方城正中为一拱门，中通圆拱形地道。由54级台阶而上出地道，迎面就是宝顶南墙，用13层条石砌筑。沿方城左右两边步道即可登上明楼。
明楼在方城之上，为重檐歇山顶，上覆黄色琉璃瓦，东西长39.45米，南北宽18.47米，南面开3个拱门，其他三面各开1个拱门，每扇门上面的门钉为9行，每行9颗，以显现九五之尊。
方城明楼以北为直经400米左右的崇丘便是宝顶，也称宝城，为朱元璋和马皇后的寝宫所在地。
明孝陵神道的最大特色在于修建与地势地势的完美结合。其不同于历代帝陵神道成直线形，而是彻底依地势山势制作为弯曲弯曲的布局。并且在每一段落的节点处安放石像生来操控空间，构成一派庄严气氛。石像生下衬托有无缺的六朝砖，使其600年来没有下沉。
石人石兽的体型都很巨大，是明代石刻的艺术珍品。
神道由东向西北延伸，两旁顺次摆放着狮子、獬豸、骆驼、象、麒麟、马6种石兽，每种2对，共12对24件，每种两跪两立，夹道迎侍。
明孝陵神道的6种石兽中，以象为最大，重达80吨，其时为了将这些石兽运抵明孝陵，冬天时，在路面上浇水结成冰，再用粗大的竹、木作滚轴，一路上用人力推滚的方法来完结运送使命。
大明朱元璋的明孝陵按照风水理论，精心选址，将数量很多的修建物奇妙地安置于地下，它是人类改动天然的产品，表现了传统的修建和装修思维，阐释了封建我国继续五百余年的世界观与权力观。其无缺的地上、地下修建系统，布局谨慎，规划庞大，修建华美，工艺精细，表现了我国封建社会最高的丧葬准则。代表了明初修建和石刻艺术的最高成果，直接影响明清两代五百余年20多座帝王陵园的形制，依前史进程散布于北京、湖北、辽宁、河北等地的明清皇家陵园，均按南京明孝陵的规制和形式营建，在我国帝陵开展史上有着特别的位置，不愧为“明清皇家榜首陵”的美誉。
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宝顶近似圆形，是一个直径约400米的圆形大土丘，即朱元璋和马皇后合葬的地宫，周围砌有砖墙。宝城扎实巩固，依山势凹凸崎岖，下砌巨石，上用明砖垒筑，厚约1米；在南边石壁上于民国时期刻有「此山明太祖之墓」七个大字。
