环翠区法院还认为，交警高杰的证言证明了其查勘现场时所测量的车辙的宽度，并非指车胎的宽度。被告人及辩护人据此认为肇事车辆的实际胎宽为16厘米（于方民的轿车胎宽19.5厘米），并以此作无罪辩护的理由不当，是对该证言的理解有误。
此次审理形成的判决书还显示，该案在原审时，曾书面通知主要证人从培泽、周承喜到庭，但其拒绝出庭。在此次审理过程中，公诉机关也依法通知其出庭质证，亦被拒绝，原因是该案已给其本人及家庭带来极大麻烦，当年其已向公安机关如实陈述了亲眼看见的事实经过，为安全考虑不愿再出庭作证。
环翠区法院认为，上述证人不出庭的原因符合相关规定，其所作陈述应与其他证据一起予以综合认定，不能因其不出庭即一概予以否认。
经潍坊中院审委会讨论，2019年10月9日，潍坊中院判决于方民无罪。
为换回清白身，于方民用了十七年时间。在原审判决生效后的2004年4月9日，于方民被开除党籍。2020年6月4日，威海市经开区纪工委办公会议研究决定，撤销给予于方民开除党籍的处分。关于行政方面的身份待遇问题，于方民称，其原单位正在协调解决中。
2020年7月1日，于方民向威海中院递交了国家赔偿申请书，他请求潍坊中院赔偿350万元。其中，支付侵犯人身自由赔偿金1531248元；支付精神损害抚慰金1456589元；支付合理的维权费用500000元；支付医保、治疗费12163.03元。此外，于方民还请求威海中院为他在山东省电视台、威海电视台等媒体公开赔礼道歉，恢复名誉，以消除错误判决造成的负面影响。
在国家赔偿申请书中，于方民写道：“我本人公职身份是国家公务员，多次被市政府记功、授奖；评为市、省先进工作者；单位被授予开发区“十佳服务明星单位”之一。就在一片赞扬声中，我莫名其妙的成了故意杀人犯。莫须有的罪名，使我名誉被毁、事业中断、仕途穷尽、政治身份被剥夺、社会评价降到冰点……”
7月7日，威海中院作出案件受理通知书，称于方民的国家赔偿申请符合立案条件，决定予以受理。不过，截至目前，该院尚未作出是否予以国家赔偿的决定。
《国家赔偿法》第十三条规定，赔偿义务机关应当自收到申请之日起两个月内，作出是否赔偿的决定。该法还规定，人民法院赔偿委员会应当自收到赔偿申请之日起三个月内作出决定；属于疑难、复杂、重大案件的，经本院院长批准，可以延长三个月。
11月17日，于方民称，主办法官电话通知他，因为法院要了解原办案人员的相关情况，所以要延长赔偿期限。11月18日，澎湃新闻致电该法官，试图了解延期的具体原因，但电话未能接通。
2006年12月8日，环翠区法院第三次判决于方民构成故意杀人罪，判处有期徒刑五年。宣判后，于方民再次上诉至威海中院。2007年7月2日，威海中院再次裁定驳回上诉，维持了原判，理由为：“原审判决认定的事实清楚，量刑适当，审判程序合法。”
在此前的2007年2月8日，于方民刑满释放，其在服刑期间获得8个月减刑。出狱后，于方民仍不服判决，坚持申诉。
2009年10月20日，山东高院驳回了于方民的申诉，山东高院认为，“经审查，原裁定已经对你对证据瑕疵所提出的质疑进行了详尽的分析论证，说理透彻，符合逻辑。”“你的申诉理由不能成立，不符合法律规定的再审条件。”
最高法介入，异地再审判无罪
于方民仍申诉不止。2018年4月26日，山东高院第二次作出再审决定书，“本院经审查认为，原审判决认定原审被告人于方民构成故意杀人罪的证据不确实充分。”这一次，山东高院未再指令威海中院再审，而是将案子交给了潍坊中院。
潍坊中院作出的再审判决书显示，2009年山东高院驳回于方民申诉后，2013年6月20日，最高法作出“（2013）刑监字第97号”函，要求山东高院对本案进一步审查处理。山东高院以“（2017）鲁立函字第47号”函指定潍坊中院对本案依法复查。
在接到山东高院再审决定书后，潍坊中院组成合议庭，公开开庭审理了本案。潍坊中院再审审理查明的证据与原审一致，但潍坊中院认为，原判认定的犯罪事实不清、证据不足。
综观全案，原审认定于方民犯故意杀人罪的主要依据除相关证人证言外，本案缺乏能够锁定于方民作案的客观证据，本案是否另有他人作案存疑；原判据以定案的证据没有形成完整锁链，没有达到证据确实、充分的法定证明标准，也没有达到基本事实清楚、基本证据确凿的定罪要求。原审认定于方民犯故意杀人罪的事实不清、证据不足，指控的犯罪不能成立，依法应予改判纠正。
