日本史籍《日本书纪》中，记载了这个年代许多我国移民入日本列岛的案例：
应神十四年，是岁，弓月君率120县人自百济到日本。
应神十六年，王仁自百济来，太子菟道稚郎子师之，习诸典籍。
应神二十年，阿知使主及其子都加使主，并率己之党类17县人至日本。
应神三十七年，遣阿知使主、都加使主等经高丽国至吴，令求缝工女，后吴王与工女兄媛、弟媛、吴织、穴织四女以归。
……
我国到日本的外来移民，首要是两大系统，即以弓月君为鼻祖的秦氏，和以阿知使主为鼻祖的汉氏，人数适当可观。弓月君秦氏一族人数多达3.5万，再加上阿知使主的汉氏，总数可到达六七万人。
这些“渡来人”，从我国带来了农耕、土木建造、陶器烧制、纺织养蚕、金属锻炼、军事策略甚至佛教文明。甚至在树立一致的中心集权大和朝廷过程中，他们也起到了严重效果。
为了便于学习其文明技术，也为了监视其意向，大和朝廷让这些“渡来人”寓居了在挨近京都的近畿区域，这就使得其时并不兴旺的滋贺县、三重县、和歌山县等当地高速开展起来。而这几个县，也正是日后最早大规模涌现出忍者的区域。
这也直接阐明：忍者文明的根由，或许要追溯到“渡来人”。这样，之后如大伴氏、服部氏等渡来人忍者氏族的呈现，也就不意外了。依据史籍中圣德太子差遣伊贺服部氏族搜集情报的记载，服部氏或许便是忍者伊贺流的先人。
三、忍者仅仅控制者的一件兵器
可是，直到忍者作业大盛的战国年代，后世所谓的忍者，却并不被称为忍者，并且一向没有一致的称谓，不一起期有不同的姓名：飞鸟年代称“志能便”;奈良年代则是“标兵”;战国年代叫法最多，撒播最广的叫法是“乱波”，这是武田信玄给起的姓名。
并且，不管哪个年代，忍者的位置都很低。前期的忍者，多身世于贫穷农人，而不是位置尊贵的武士。在日本贵族眼里，忍者仅仅一件兵器、一件东西。因为使命需求，他们一般不会与敌人正面一决雌雄，而是为达意图无所不用其极，忍术正为此而诞生。
一般忍者都要蒙面(领袖在外)，那是为了不让对方发现身份。他们不能以真面目示人，终其一生都要隐姓埋名，不能留下只言片语，避免日后东窗事发。在执行使命时则要肯定服从命令，没有自在可言。
可是他们的作业大体相似，首要是为主君进行秘策、损坏、暗算、搜集敌方前哨情报、扰乱敌方后援基地等种种谍报活动。
至于所谓忍术，其理论基础，首要是由我国传入日本的孙子兵法，配上“风林火山”四字告诫组成，所谓疾如风、徐如林、侵掠如火、不动如山，然后再加上一些神通和在山中的埋伏技巧。
四、忍者的黄金年代——日本战国年代
战国年代，是忍术大兴的年代。在这紊乱的年代，各地兴起的台甫，十分需求忍术为自己征战、探听情报。
比方声称“战国榜首兵法家”的武田信玄，便是一位忍者的忠诚拥护者。天分多疑，并且十分厌烦他人知道自己国家的秘要，因而他专门练习了一批忍者，去帮他处理这方面的作业——侦测，暗算。他把来自于甲斐，信浓，越后三地的无业游民、匪徒安排化，教以山地战以及其他战争技巧，把他们练习成为标兵和特务专家，这便是闻名的武田“乱波”。
一起，这个年代，异域传入的科技，以及各个工作的工匠人数暴增，使得许多忍者能够以民间匠人的身份技术，去从事谍报作业。
这时，忍者作业现已有了完好的系统和理论，包含四项根本戒律：
禁绝乱用忍术(只能用在公务上)
放弃全部自负(逃命要紧)
有必要三缄其口(即便为此失掉性命)
肯定不能走漏身份(藏匿身形是最根本的忍术)
