北魏衰落后，突厥强大起来。隋朝时期，隋文帝试图分裂匈奴，支持突利反叛。599年，隋文帝让突利在河套地区建国，称为启民可汗，建立了“东突厥”。从此突厥分裂为了东西两部分，东突厥成为了隋朝的附庸。这一幕和汉朝支持南匈奴是同样的战略。隋朝末年，东突厥强大起来，不在臣服隋朝，河套地区因此失去控制。
河套的失守导致关中地区再次暴露在了游牧民族面前。隋朝，突厥就不断入侵关内，隋唐之际的薛举、窦建德、李轨、高开道、王世充都不得不向突厥臣服。唐朝建立后，突厥依然不断入侵，626年，突厥军队直逼唐都长安城外渭水便桥之北。想要关中得以安宁，就必须重新控制河套平原。629年，唐朝出兵北上灭东突厥，占据河套地区。之后，唐朝又以河套为基地，于647年灭薛延陀汗国，唐朝的势力一度控制整个漠南和漠北。唐朝在漠南设置单于都护府，在漠北设置了安北都护府。这是中原王朝首次在漠北设置机构。不过漠北的控制时间并不长，682年，东突厥复国，此后又有回鹘取代突厥，唐朝和北方汗国大概以戈壁为界。
三，内蒙古的外蒙古的形成
五代十国以来，漠南地区被西夏，契丹、女真等民族占据。此后蒙古族兴起，他们消灭了东亚大陆的所有政权，建立了强大元朝。由于蒙古的空前强盛，使得漠南漠北的民族都融入了蒙古族。但是漠南漠北还是有区别的，元朝建立后，在漠北设置了岭北行省，是蒙古汗国本部。而漠南则属于陕西、中书省等管辖。
元朝灭亡后，蒙古族就逐渐分裂为了漠北蒙古（喀尔喀蒙古）、漠南蒙古和漠西蒙古三部分。由于该时期蒙古各部分裂，征战不断，因而势力不断被削弱。明朝后期，林丹汗曾经一度统一了漠南蒙古，但是时间也不长。1632年，皇太极击败了林丹汗，漠南蒙古各部纷纷臣服于皇太极。清朝将漠南蒙古称为“内札萨克蒙古”，简称为“内蒙古”，蒙古文意思是“阴山的南面”。
喀尔喀蒙古直到1691年才纳入了清朝的版图，当时清朝将喀尔喀蒙古各部统称为“乌里雅苏台”。1731年清朝设置设立乌里雅苏台将军。清朝末年，喀尔喀蒙古逐渐被称为“外蒙古”。清朝灭亡之际，俄罗斯就开始暗中支持外蒙古独立，甚至也支持内蒙古独立。最终外蒙古在1945年的雅尔塔会议上被确立独立。从此内外蒙古正式分家。
