现在已经无法看到真实的南美土著马，但是通过种种被发现的遗迹，以DNA等现代科技手段对它进行研究，发现它们是马属科，应当是上新马迁徙到南美洲后进化出的品种。南美土著马的外观更接近驴，身材高大，是两百五十多万年前万年平行期的马。
一、南美土著马的特征
南美土著马的形态特征并不稳定，以目前掌握的资料来看，至少在很长一段时间内，它的形态具有脊索、背神经管以及咽鳃裂。南美土著马作为脊索动物，拥有脊索动物的特征，在消化管的腹面发现了它的心脏。经过生物学家研究发现，它们的循环系统比较特别，是闭管式的。南美土著马两侧对称，分节，这些特征只有无脊椎动物才具备，这也从侧面印证了无脊椎动物到脊索动物之间的关系。
二、南美土著马的历史
地球上第一个类马动物出现在五百四十万年前，当时的类马动物与现在的马差别很大，尤其在体型方面，只能达到一个成年犬类的大小，脚底是柔软的肉垫。这种类马动物最早出现在北美洲，实际上马科动物进化的重要地区就在北美洲，在北美洲完成了大部分的进化进程后才逐渐被引入非洲和亚洲地区。马科动物被引入后，受到当地其他物种的影响，又进行了新的进化，演化出驴等品种。
北美洲虽然是最早出现类马动物的大陆，但是冰河期的最后阶段，马类就已经在北美洲声销迹灭了。后来人类在中东地区发展了马类的驯养，马类又被重新引入到了北美大陆，成为后来的北美马科动物。人类将马驯养后为自己所用，不仅仅在农业种植上大放光彩，在运输货物上也起到极大的作用，加快人类历史进程。