然而，尚之信卖力地征剿叛军，非但没有换来康熙帝的嘉奖，反而害得自己丢掉性命。康熙十九年（1680年），“三藩之乱”渐进尾声，吴三桂之孙吴世璠（吴三桂此时已死）败局已定，康熙帝便以尚之信“反复无常”为借口，决心收拾他。当年三月，尚之信的护卫张永祥、张士选在清廷的唆使下，秘密赴京揭发主公犯有“谋逆罪”，康熙帝遂派刑部侍郎宜昌阿等人赴粤调查。
康熙帝画像
尚之信明白宜昌阿等人的真实来意，但自恃清白且有平叛之功，认为朝廷绝不会要他的性命，因此没有做任何反抗，而是乖乖地束手就擒。可惜，尚之信打错了算盘，宜昌阿并没有押着他赴京面圣，而是按照康熙帝的授意，在当地逼迫其自杀，时在康熙十九年（1680年）闰八月。尚之信在平叛事业中立下大功，最终却落得如此下场，堪称清朝最冤的汉族藩王。
