抗原转换（左）和抗原漂移（右）的比较可以发现抗原转换完全是基因重组，而漂移只是小突变
灭活流感疫苗初战告捷
在1941年12月珍珠港事件促使美国正式参战之前，军事人员就已经担心大流行性流感可能会随着战争中涉及的大规模部队调动一起重新出现。毕竟，1918年的最新灾难性全球暴发与战争密不可分。美国于1941年成立了专门的科学咨询机构来应对这种疾病-陆军流感和其他流行病调查与控制委员会。
目前我国生产的流感灭活疫苗均为裂解疫苗
5.尝试亚单位疫苗技术：当前的亚单位疫苗由富集的H和N抗原组成，同样，比灭活疫苗的不良反应会更少一些。通常，裂解或亚单位疫苗对具有相似抗原特性的病毒具有60-90％的保护性。
回过头，再试试减毒活疫苗
虽然在技术上进行了改进，但无法改变的是灭活的流感疫苗诱导粘膜和细胞介导的免疫相对较弱，并且由于它们对漂变变体的交叉保护不可靠，因此必须每年重新配制疫苗以提供的最佳保护，而人类也必须每年接种流感疫苗，以保证体内的抗体滴度，以及能够对最新流行的流感病毒株产生免疫力。
从早期开始，研究人员就开始倾向于使用活病毒可能产生广泛的免疫力。伯内特早在1940年代初成功将流感病毒在鸡胚尿囊膜传代后，就提出了一种减毒活疫苗方法，但是由于流感委员会支持下开发的灭活疫苗的出现，他就放弃了这一策略。
由于无法开发出可靠，有效的减毒方法，导致对流感病毒减毒活疫苗的研究速度减缓了数年之久。可以被当做疫苗的稳定减毒活病毒必须能够感染呼吸道并刺激细胞和体液免疫又不会引起人类疾病。
经过各种减毒方法的实验后，证明冷适应株是最佳的方法。甲型和乙型流感病毒在25°C下在组织培养和卵中的连续传代会在病毒基因中引入点突变，从而导致冷适应。对温度敏感的减毒病毒株，然后在实验室中将其与预计在特定季节会在社区人群中传播的病毒株进行重组。这种减毒活疫苗以与自然流感感染相似的方式经鼻内给药，可诱导细胞和体液免疫，包括粘膜反应，并已证明对儿童具有很高的保护效力。
另外，有证据表明，至少在儿童中，与灭活疫苗相比，它可能更可靠，更有效，并能以更大的程度上抵抗抗原性漂移变体。
期待更完美的流感疫苗
由于H1N1和H3N2甲型流感亚型的变体仍然是全世界流行性人类感染的主要原因，因此，目前的疫苗为包含这些基本基因型的代表，以及预计会在下一场流感季节中传播的1种或2种乙型流感病毒共同组成。如果是2种甲流+2种乙流病毒株，便组成了四价流感疫苗，如果是2种甲流+1种乙流病毒株，便是三价流感疫苗。无论是四价还是三价流感疫苗，都是世界卫生组织推荐的流感疫苗品种。除非当年正好流行的是四价覆盖而三价没有覆盖的乙型流感病毒株，否则两种疫苗保护效果并没有太大差别。
从中可以发现以灭活疫苗为代表的配制和生产过程是劳动密集型的，要耗费时间，并且这种预测伴随着固有的风险水平；在过去的几年中，疫苗与实际社区传播的病毒不匹配，导致了流感发病率和死亡率的突然升高。减毒活疫苗也并未从实质性地改变上述基本过程，这使得当前可用的流感疫苗在保护大流行方面都不是最理想的平台。
因此，流感疫苗还不完美，历史有待于后人的书写。针对流感病毒的疫苗预防的新方法正在开发中，将创新的分子技术应用于流感病毒特征性的抗原漂移和转换问题，以避免需要每年重新配制疫苗。
流行性感冒的终极目标应该是开发一款通用的、交叉保护的疫苗，该疫苗可在大流行期间和大流行期间针对所有病毒株使用。由于流感病毒具有固有的变异性，因此这种疫苗可能必须基于保守的抗原，并且可能还需要通过使用佐剂或其他方法增强免疫反应而得到增强。新冠疫苗同样必须面对的难题
