在传说中说写到的是如来杀了孙悟空，因为不论是记载，还是《西游记》后期的演绎，都能看出很多的破绽，从分析上看，如来与六耳猕猴在之前就应该是认识的，但是如来通晓天下事，这一点有些解释不通。其实如来很明显就能够区分孙悟空的真假，如来一心向佛，不应该直接杀死一只猴子。
一、如来杀死孙悟空的论据
孙悟空与六耳猕猴长得一模一样，这一点谁都分不出来。即使是如此，其实如来也能够区分真假的孙悟空，而真正的孙悟空自己只能当做哑巴，在吃了黄连之后无法说出自己的痛苦。还有一点，六耳猕猴应该就是如来佛祖派遣来的托，主要就是为了铲除孙悟空。
很多人在看完《西游记》之后都知道，孙悟空这个形象非常的叛逆，但是如来在西天上是最高的官。试问一个统治者怎么可能会容纳一个叛逆的下属，同时六耳猕猴与孙悟空共同见到如来时，孙悟空所说的是俺老孙，而六耳猕猴自称为弟子，所以能够看出如来与六耳猕猴的关系非浅。
孙悟空会的本领很多，但不是一朝一夕就能够学会，而六耳猕猴身上的本领与孙悟空一模一样。所以六耳猕猴的本领也不是一朝一夕能够练就出来，应该是在很早以就学习过。通过这一点能够看出，六耳猕猴绝对经过高人指点。这个高人就很有可能是如来佛祖。
还有比较明显的一点，因为在假美猴王出现之前，孙悟空一直都与唐僧闹别扭。但是自从这件事之后，孙悟空一直老老实实，本本分分的待在了唐僧身边，并且用心尽力的去照顾师傅。可以说孙悟空的性情大变，真的很值得人怀疑。在这件事情发生的前后，孙悟空的性格完全大变，并且行为举止也稍有变化。
二、关于如来杀死孙悟空的另一个版本
其实两只孙悟空的出现，让很多神仙也比较为难。最终都来到了灵山，可是大众还是无法去区分。又来到了玉皇大帝处，在原著里面所讲到的是六耳猕猴，得知如来说出了自己的本相，所以有些害怕。立即想逃走，并且变成了蜜蜂。可是如来用一个杯子将蜜蜂给盖住，最终六耳猕猴被孙悟空打死。