后来战事不断，为了补偿戎行数量的缺乏，募兵成了常态，不时弥补，到了嘉靖年代便大规划打开，卫所准则完全边缘化，募兵成为了明军主力。
募兵称之为营伍兵，编制、待遇与卫所不同。
营伍制下，将官分别为总兵、副将、参将、游击、千总、把总等，而卫所制为都指挥使、指挥佥事、千户、百户、总旗、小旗。一个卫为五千六百人左右，营伍制一营的军力大约在两千两百五十人到四千五百人之间。卫所部队有土地播种，而营伍兵有军饷可拿。
募兵制实施今后，明军的战斗力得到了大幅提高，最为闻名的莫过于东南地区的戚家军、俞家军，东北地区的关宁马队，西北地区的秦兵等。这些武士以壮龄从军、工作作战，而且凭军功能够拿赏金或升官，完成阶层跃迁，因而作战士气更为旺盛。
营伍制的存在，使得明军得以与国表里对立实力打开作战，比方万历年间入朝征倭，部队尽管人数不多，但都是从辽东、宣府、延绥、浙江等地的作战劲旅中抽调，因而取得了对倭作战的成功。假如此刻明朝仍然遍及运用卫所制，那么部队的战斗力底子无法应对远程远征以及耐久作战。
营伍制拉开了明朝军事变革的前奏，却没能一向走到终究——由于募兵制太费钱了!在明朝初年，国家财务姑且宽余，外部战役烈度较小，因而营伍兵们的军饷规划也并不巨大。可是到了中后期，募兵成为干流，募兵费用也节节攀升，但国家的财务却日趋溃散。
小冰河期到来今后，农人起义相继迸发，多年来头疼的蒙古部落也张狂向边塞进攻，女真部落在东北鼓起，以掳掠、残杀削弱华北、东北地区明朝实力。明廷只得募更多兵来应对，故而形成了“开流节源”的局势。
比方明朝儒将谭纶曾对朝廷苦叹道：“我国长技，无如火器，欲练兵三万，比得鸟铳手三千人为冲击”，但“计三万人，宜各月给银一两五钱，岁费四十五万，司农告匮，一难也被。”核算一下发现，适当于每名战士十八两，这个程度现已吓坏了户部和兵部，而这仍是隆庆年间的工作。
到了崇祯年间，财务状况有过之而无不及，但每名战士的年俸现已超过了四十两，战士在军饷缺乏的情况下，哗变也成了常有的工作，这就直接影响了战士的忠诚度和士气值。
更为严峻的，是募兵制下，部队的归属问题。明末的官兵私有化问题从来严峻，比方各个边镇，有规划不小的家丁集体;而募兵制鼓起今后，部队大多归将领一切，比方浙江的招兵，现已不再为部队选择将领了，而是将领自行募兵，募得一百人授把总、募得三千人授总兵。
如此一来，戎行私人化问题就难以反转，崇祯皇帝殉国后，南京京畿有江北四镇、荆襄有左良玉，拥兵近百万，可是这些士卒都是为将官个人效命的部队，他们的归宿也就和将官相同了——高杰在被刺杀今后，部队逐渐溃散割裂;刘泽清、刘良佐两人屈服满清，部队则成为了清军的前锋;黄得功部则死战殉国。
这些部队终究的归宿，都与其将官共同，而从不承受朝廷指令。这天然与明朝武士生计的大环境有关，但将官个人权利胀大则是重要因素之一。
所以，任何变革，都必须是社会性、全面性的。明朝军事的变革的问题在于：
一方面是太晚——没能在前期逐渐找到一个合适本身国情的路途，而在战事迸发遽然大规划扩军，不曾考虑结果;
另一方面，是经济准则的落后确保不了部队巨大的开销。
相同的年代，明朝农人的税赋是日本的二非常之一、英国的四非常之一，但大众却担负严峻、国家赤字不断，社会急需一场全面的变革去打碎枷锁，一场军事变革是远远不够的。
