在秦代的司法系统中，从廷尉到亭长，各级各部门都有不同的职责，分工较为明确。基层的亭长、啬夫等，有处理一般民事案件和刑事案件的权力，有抓捕犯人和向上级移交的权力，但没有审判权，只能调节和进行最基本的处罚。从县级开始，各级司法部门开始有了审判权，县令有审判权，从一般的刑罚到死刑，县令都可以判决。
但死刑案件必须上报郡里，郡里批复后再上报廷尉，经廷尉的同意后才可执行死刑。县里的重大案件和各个死刑案件，一般都由县令直接负责办理，以力求公平公正。郡守和县令的司法权力相仿，在判处死刑后也要上报，廷尉批复后方可执行。郡中如有重大案件，如杀人越货等，郡守要对从追捕到最后判决全程进行处理，并上报廷尉。
秦朝建立的这种三级审理制度和允许上诉的制度，在一定程度上保证了司法的公正性和量刑的合理性。这种做法被后来的历代王朝所模仿，奠定了我国司法审理制度的基础。
《秦律》是中国历史上一部影响深远的法典，它使秦朝初步建立了我国封建社会的司法制度，并得以依靠法律维护地域辽阔、人口众多的大帝国的完整和统一，其积极作用是应该被肯定的。尽管秦代的法律有其残酷和野蛮的一面，维护的是地主阶级的意志，保护的是不平等的封建等级制度，但不可否认的是，《秦律》帮助初生的秦王朝稳定了社会秩序，保障了国家各项事务的正常运作。也正是在稳定这一大前提下，秦王朝才有机会进行无数的制度创新，留下了长城、直道、灵渠等泽被后世的工程，也为后世留下了一整套可供借鉴模仿的优秀制度，保障了东方文明此后长期领先于世界的地位。
