在长达 7 个月的西南战争期间，政府军集结了8个旅团再加上部分海军合计6万人，政府军伤亡1.6万人（阵亡6000人）；反抗的武士军最多时候达到了4万人，在战争中大约有2 万人伤亡。西南战争“后遗症”
西南战争以明治政府的胜利而告终。其对日本发展的影响是巨大的。
首先，西南战争为明治改革主力的武士势力的彻底铲除。
西南战争后的明治政府开始对全国进行更系统的改革，战争后明治政府加快了海陆军的建设，使新式军队逐渐成为日本对外扩张的工具，而且义务兵制度的完善完全取代了以前以武士为兵源的古代日本，实现了军制改革的日本一只脚已经迈入强军之列（反观当时的大清拥有前进的武士，但军队制度还是沿袭宋明时期，直到清末小站练兵才开始近代化改革之路）。
明治政府新军
其次，西南战争对刺激了日本军工和财阀的发展。明治政府讨伐西南士族需要巨额的军费、武器和物资，这些财阀的发展为后续的日本工业近代化提供助力，同是战争的内需也催生了很多军工企业，为其后期军工自主化打下了基础。
明治时期的日本工厂
最后，明治政府的军队的胜利，扫除了日本的士族势力，西南战争以后，这些武士阶层也等同于普通市民，一样进入工厂上班，贵族特权的消逝，让更多的人从以前拥护藩主变成了真正拥护天皇，“废藩设县”也真正让日本实现了统一。雨田君说
虽然西乡隆盛等人在民间拥有雄厚的基础（《最后的武士》就是以其为原型），但其代表的武士阶层并不能为近代日本所接受，甚至还是阻碍日本发展的绊脚石，因此西南战争的胜利让日本从一个武士之国，真正变成了一个近代化国家
可以说，西南战争政府军的胜利，标志着明治维新在日本全国真正意义上的实现。
