消灭滕胤以后，孙琳升为大将军、假节，封为永宁侯，自恃显贵而傲慢自大多次做出无礼的事情。当初，孙峻的堂弟孙虑参与诛杀诸葛恪的谋划，事后孙峻一直厚待他，封其为右将军，节盖（皇帝对臣下的一种恩宠待遇），让他参与商讨各类政务。不久，孙琳与孙虑之间产生摩擦，孙虑十分怨怒，与将军王淳合谋要杀掉孙琳。孙琳得知消息后，杀掉王悖，孙虑也服毒自杀。经过这几次事件，孙 琳逐步消灭了自己的政敌，巩固了自己的地位，他更加专横跋扈了。
过了些日子，魏国大将军诸葛诞占据寿春谋反，把守着城池，并向吴国请求救援。吴国派出文钦、唐咨、全堵、全择等人率军3万前往救援。魏国镇南将军王基围攻诸葛诞、文钦等突然进入城内。魏国尽遣20多万军队增加对诸葛诞的包围。朱异率领3万人屯驻在安丰城，作为文钦的羽翼。魏国兖州刺史州泰率军到死伤人孙琳于是全力征调卒进驻镜里，又派遣朱异率领将军丁奉、黎斐等5万人攻打魏国，把军需物资留存在都陆。朱异率军驻扎在黎浆，派将军任度、张震等人招募敢死队员6000人，在黎浆以西6里路远的地方搭浮桥趁夜间渡水，修筑起一道半月形的营垒，但马上就被魏国监军石苞及州泰所率之军击破，吴军被迫退却，占据制高点。接着，朱异重振军队包围五木城。石苞、州泰等率魏军转攻朱异，朱异兵败退回。魏国 泰山太守胡烈用奇兵5000人从隐蔽的路径袭击都陆，烧尽了朱异的军需粮草。孙琳发兵2万人支援朱异，命令朱异拼力死战，朱异不肯。孙琳就在镜里杀了朱异，另派他的弟弟孙恩救援，遇上诸葛诞已失败，也就无功而返。孙琳此战既没有能救出诸葛诞，反倒损失军队，杀戮名将，没有人不怨恨的。
此时，吴主孙亮开始亲自处理政务，经常责难盘间孙琳，孙琳很是恐慌。他回到建业后，托病不朝见皇帝，在朱雀桥南建造房屋，指派他的弟弟威远将军孙据进入苍水门值班守卫。他的弟弟武卫将军孙恩、偏将军孙干，长水校尉孙闾分别屯驻各兵营，想藉此把持朝政以稳固自己的权位。孙亮心中怨恨孙琳，于是追究公主鲁育被杀的原因，责怪虎林督朱熊及朱熊的弟弟外部督朱损没有纠正孙峻当时的行为，下令丁奉在虎林杀掉朱熊，又在建业杀掉朱损。孙琳劝谏阻止，未准。孙亮与孙琳的矛盾一触即发。为了稳定政权，孙亮马上又与公主鲁班、太常 全尚、将军刘承商议，要诛杀孙琳。孙亮的妃子是孙琳堂姐的女儿，将这一策划 告诉了孙琳。孙琳带着人在夜间袭杀了全尚，派遣他的弟弟孙恩在苍水门外杀掉了刘承，跟着又包围了皇宫。
他派光禄勋孟宗到宗庙里向祖先神位禀告，要废掉孙亮。然后召集各部门的官员议论说：“少主放纵胡涂，不能让他身处皇位，继承 祖先事业。我已经禀告先帝废除他。各位大臣如果有不同意的，请提出不同的看法来。”大臣们全都十分震恐，连声表示赞成。尚书桓彝不肯签名，孙琳一怒之下杀死了他。于是孙琳指使中书郎李崇夺下孙亮的皇帝印绶，将孙亮的罪状分发到各国各地。典军施正劝说孙琳征召琅笳王孙休立为皇帝。孙琳同意了，派遣宗正 孙楷呈递书文给孙休，历数孙亮的罪状，请孙休即皇位。孙琳又派将军孙耽遣送孙亮前往封国，将公主鲁班迁徙到豫章（今江西南昌）。此事发生在太平三年（公 元258年）。
之后，孙琳完全控制了中央大权，他由此更加肆意妄为，竟然派人烧掉大桥桥头伍子胥庙，又毁坏佛寺，处斩道士。孙休即位后，孙琳自称在野臣民。他假意声称自己毫无才德，请求致仕。孙休知道他的想法，就下诏褒扬他的功德，加封他为丞相、荆州牧。孙琳的弟弟们也因此得势，一家之中有五人封侯，都执掌 皇帝的亲兵，权势超过了君主。吴国朝臣中从来不曾有过这样的事情。
03、恶贯满盈
孙琳的跋扈一开始就引起了孙休的不满，他即位之初就想除掉孙琳，但因时 机不成熟而暂时拖延。但这一天的到来是迟早不可避免的事情。
有一天，孙琳携带牛酒进献孙休，孙休没有接受，他就带到了左将军张布那儿。畅饮了一阵子之后，孙琳口出怨言说：“当初废掉少主时，许多人都劝我自立为帝。我以为皇上贤明，因此迎接他。今天的皇帝没有我就立不了，可我现在奉献酒礼而遭拒绝，看来我在皇帝的心中与其他大臣没有什么区别呢，应该另作图谋了。”张布将这番话告诉了孙休，孙休听后不顾声色。他恐怕孙琳有变乱，因而多次加以宽赐，又再加封孙恩为侍中，与孙琳一道审阅公文。有人告发孙琳心怀怨怒，侮辱皇上，想要造反等等，孙休就把这人抓起来交付孙琳，以显示自己对孙琳的信任。孙琳杀掉了这个人，由此更加恐惧。他托孟宗说情，请求去武昌驻守。孙休允许了他，命令孙琳统领的中营1万多精兵与他随船同往。所提取的武库兵器，也一并交给他。将军魏迪劝孙休说：“孙琳屯驻外地一定会有变乱。”武 卫士施朔又报告说：“孙琳准备造反已有迹象。”孙休暗中询问张布，张布和丁奉 商议，准备在腊日聚会时杀掉孙琳。
