因清军势大，扬州守军士气低迷，所以攻城战只持续了短短数日。四月二十五日，清军攻破了扬州城，并在巷战中清剿了南明守军。多铎恼恨扬州城军民同仇敌忾，与自己做对到底，于是便纵容属下烧杀淫掠，造就“扬州十日”的悲剧。
那么，史可法究竟去了哪里呢？
有人说史可法在破城那天就已出逃，不知所踪。不过，史可法逃出生天的过程，史学家各执一词。有学者认为，史可法缒城出走，提出这种观点的学者参考了计六奇在《明季南略》中的说法：“四月二十五日，清兵诈称明总兵黄蜚的援兵到，史可法令开西门放行，清兵进城，即攻击明军。史可法于城上见此状况，知无可挽回，即拔剑自刎，左右相救，遂与总兵刘肇基缒城潜去。”
还有一种说法是史可法“跨白骡出南门”，当然，这种说法带有浓厚的传说性质。乾隆朝《江都志》中记载了一些扬州风闻，其中就有史可法骑骡出城的传说。
在扬州当地，还流传着这样一首诗：
相公誓死犹饮泣，百二十骑城头立；
瞬息城摧铁骑奔，青骡一去无踪迹。
史可法若已逃出扬州城，他究竟去了哪里呢？
计六奇在顺治六年曾在旅途中偶遇一嘉兴人，据此人说他便是当年扬州十日事件中的幸存者，当时破城之后清军在城内搜索史可法的下落，却未找到这位南明名将。许多文献都参考了这一说法，认为史可法在扬州破城后不知所踪。
还有一些人认为，扬州被攻陷后，史可法自尽殉国。
例如《桃花扇》里就提到史可法在离开扬州城后曾骑着马过河，因水流湍急而溺水身亡。亦有说法称当时的史可法遭清兵围追堵截，自知逃生无望的他主动投水自杀，以身殉国。
不过，上述说法都与正史中的记载相左。不论是《清实录》还是《明史》中，均称史可法遭到清兵俘虏，被满人杀害。《清实录》中的原文为：“攻克扬州城，获其阁部史可法，斩于军前。”相比之下《明史》中的细节更加丰富，称史可法在扬州城破后想要一死了之，被部将抢救下来后一行人逃往小东门，却被守在这里的清军俘虏。史可法临终前大喊道：“我史督师也！”随后英勇就义。
史可法嗣子史德威亦支持史可法被俘遇害的说法，他在《维扬殉节纪略》中指出：扬州被清军攻陷后，史可法先是自刎未遂，与部下一同逃往城门时被大量清军俘虏。抓到史可法后，多铎仍妄想通过史可法的影响力控制江南士人，所以，对史可法十分谦恭，称他为史老先生，并给出“为我收拾江南，当不惜重任也”的许诺。
不过，史可法严词拒绝了多铎的劝诱：“我为天朝重臣，岂肯苟且偷生，作万世罪人哉!我头可断，身不可屈……城亡与亡，我意已决，即劈尸万段，甘之如饴。”
多铎无法让硬骨头的史可法折服，干脆命人将史可法杀之后快。
那么，这么多关于史可法结局的说法，究竟哪一种的可信度更高呢？
笔者认为，《清实录》与《明史》中有太多后人修改的痕迹，所以，史可法的结局或遭到清廷史官的篡改，未必真实。即便史可法自刎或投江而死，清廷亦不能放出史可法以身殉国的消息，而是要刻意抹除掉史可法身死报国的细节，以免更多人效仿。至于《维扬殉节纪略》中的说法，也有不实之处，不排除史可法后人为美化史可法形象而添加内容的可能。
不过，史可法逃生的可能性极低，笔者认为：史可法的结局必是被俘遇害或自尽报国。
首先，扬州被破之日清军围堵了所有城门，史可法及其部将的目标极大，不可能逃过清军的围堵；
其次，在扬州城破之前，史可法已给妻子、母亲、叔父、兄弟、儿子留下五封遗书，在遗书中已明确表示自己将“一死以报国，固其分也”。
由此可见，不论当时的情况是怎样的，史可法都已决定殉国。
根据文献记载，史可法的部将刘肇基在破城之前就已被清军射杀，所以，他跟随史可法一块“缒城潜去”的说法显然是存在水分的。
