大失所望的汉献帝只能化名诸葛亮，自号卧龙，隐居于南阳，自此不问世事。
而这边刘备在聚拢关羽张飞等一众兄弟之后，带着队伍来荆州投奔汉献帝。刘备胸怀天下，更不忿汉献帝如此堕落。于是三顾茅庐，要汉献帝再度出山。
汉献帝在刘备的感染下，重新燃起斗志。但此时曹操大势已成，刘备却实力弱小，如果贸然公开身份，无疑会成为众矢之的。于是他以诸葛亮的身份，投入刘备麾下，充当谋士。待收复河山之后，刘备再将真相昭告天下，拥汉献帝为帝。
但，刘备和汉献帝并没有等到那个时候。
公元220年，曹操去世，曹丕接假汉献帝禅让称帝，建立魏朝，东汉灭亡。此时刘备割据益州，名不正，言不顺，只能是自立为帝，延续汉室。并以此为基础，打出讨逆复国的旗号，继续与曹魏对抗。
刘备称帝之后，不听诸葛亮劝告，为给兄弟报仇，举国伐吴，最终兵败夷陵，魂归白帝城。
临终前，刘备幡然悔悟，自己一生为主，却因一时意气用事，几乎葬送了着来之不易的基业，复汉希望渺茫，他愧对诸葛亮。
于是他握着诸葛亮的手说道：“君可取而代之……”
但是诸葛亮没有，因为他知道，就算是他恢复汉献帝的身份，这天下也容不下他了，包括蜀汉。这些人是因为刘备才聚在一起，而不是因为他。
所以，自此以后，没有汉献帝，只有诸葛亮。而诸葛亮的毕生目标只有一个，那就是北伐，拿回祖宗基业。
