另一项重要的准备作业是进步北京的物资运送才干，添加物资贮藏。洪武年间至永乐初，北京、辽东军饷都依托海运从南边运去。为此永乐二年（1404年）十一月设置天津卫，并制作转运粮仓。营建北京和将来迁都，朝廷官员的俸禄、营建工匠军民的口粮、木材砖瓦，都需求取自南边。海运危险大，运力缺乏。疏通水路、进步漕运才干十分急迫。
清乾隆时的天津，[英]威廉·亚历山大绘
所以在北京至通州运段，疏通运用了元代通惠河。为添加补给水的流量，进一步开发西湖景，即元代的瓮山泊。永乐四年（1406年）八月和次年九月，“修治”西湖景的堤岸和各个闸门。五年五月，构筑从西湖景通向下流的河道，收拾从文明门至通州的各闸。六年四月、十月，先后设惠河、庆丰、平津、弄清、通流、普济、广源、文明等八座闸的闸官，掌管启闭，保证疏通，阐明这次“修治”成功了。通州迤南的运段，即京杭大运河的山东段，元代至元年间开凿有会通河，自东平至临清，长四百五十余里，可是现已淤塞了大约三分之一。永乐九年（1411年）二月二十八日，皇帝命工部尚书宋礼等掌管疏浚工程。宋礼不辱使命，他听取汶上白叟白英的定见，在一处叫做南旺的高地上筑堰和坝，使汶水分流南北，“十之四”南流，“十之六”北流，接济漕河之水，使运河疏通无阻。漕运到北京的粮食一年可达百万石。到永乐十三年，完全中止了海运。
与进步水运才干一起，陆路也增设了“递运所”。永乐五年十二月，由于营建北京，需求运送的物资许多，所以在卫辉、汤阴、台甫、浚县和南馆陶增设了五所递运所。永乐七年（1409年）十月，从良乡到景州再添加九所。永乐十六年四月，又一下子在北京、河南设了二十一处。据《明史纪事本末》记载，洪武时期所建的递运所每所需求民丁三千人，车二百辆。老百姓终年奔走，不得歇息，永乐时期运送使命只能愈加深重。漕河和递运，把营建北京所需海量物料运进北京。
“四年闰七月初五日”之后，采运大木很快就开端了，这是准备修建材料的艰巨工程。永乐五年正月，皇帝指令工部，春天是农忙时节，军民砍木不止，会影响农时。要求去核实，但凡一户之中人丁少，或屯田的战士，要放回来。这个指令至少在四川没有履行。五月初十日，在那里采木的工部尚书宋礼给朝廷陈述了一个特大喜讯，“有大木数株，不藉人力，一夕出天谷，达于江，盖山川之灵相之”。（《明太宗实录》卷六五）皇帝喜不自禁，阻止了群臣赞颂他的积德行善，把这件奇特的作业归功于山川之神的奉献。赐这座奉献大木的山名“神木山”，派礼部官员前去祭祀，为山神建祠堂，指令翰林院侍读胡广编撰碑铭记事。胡广有板有眼地描绘了这件神异之事，说宋礼在马湖府深山砍伐到径围逾丈的几株大木，正策划需求万夫才干运下山岭，一个夜晚，大木忽然自行，吼声如雷，把一块挡道的巨石冲开，本身毫无伤损，这明显只要神的力气才干做到。他顺势把神的护佑与营建北京联系起来：“壮哉北京，龙飞之所。帝用诒谋，大启厥宇。……神衷显宣，嘉征斯应。以兆皇基，万世永盛。”（明·胡广《敕建神木山神祠之碑》。转引自《史料长编永乐洪熙宣德朝卷》，榜首九八条）
宋礼在神木山砍伐的大木是楠木，是永乐年间北京宫廷大木构架运用的首要建材。至今在判定故宫古修建时代时，首要结构是否运用楠木，仍旧是判别明代修建的一个重要依据。明代地理学家王士性在他的作品《广志绎》中，十分精确地描绘了楠木的性状。凡人间之树，全都树干曲折，枝条扶疏，长着巨大的树冠，只要楠木和杉木树干垂直。可是杉木的根部虽粗，树梢却很细，不契合做修建材料的要求。楠木则高数十丈而树干上下径围类似，树干上又不生枝杈，直到树顶才散干布叶，像撑伞相同。所以天然生成楠木，好像是专供殿堂柱梁之用，非楠木不能满意殿堂巨大之需，非殿堂不能使楠木物尽其材。王士性以为，楠木首要生长在贵州一带人迹罕至之处，运木出山，好不容易，“一木下山，常损数命”。朝廷在湖广、四川组织采木，仅仅由于这两处较贵州便于处理罢了。
