王健伟表明，接下来需求承认的是，已然是环境样本或许形成露出，那么病毒是从哪儿来的呢？把盛行病学和测序技能相结合的基因组盛行病学，关于追寻感染的来历是一个十分有用的东西。但在环境样本中，病毒的含量是特别低的，而且样本量又十分大，经过高通量测序有必定困难。“所以，时令在北京大学谢晓亮教授的支持下，清华大学王建教授的团队也开发了一种根据SHERRY的Minerva技能，经过这个技能能够把文库构建的速度缩短到5个小时以内，测序的速度愈加方便；别的，还建立了基因组富集的办法，使载量很低的样本能够得到有用测序。”
王健伟介绍，根据这样一个技能系统，科学家经过协作，对110份新冠病毒阳性的感染者和环境样本进行了病毒基因组测序，得到了72条高质量的全基因组序列，包含56条感染者的基因组序列和16条环境样本的基因组序列。环境样本的病毒载量都是十分低的，“可是经过这样的办法时令也得到了它的全序列。关于这个序列进行剖析发现，每一条序列上都有8个骤变的位点，有53%的序列只要这8个骤变，其他的序列还有其他一些骤变，这就阐明这些骤变是单一的来历，从病毒基因组的层面也证明新发地的感染是单一来历的。“
在这个根底上王健伟等科学家做了病毒的进化树剖析，“就像时令排家谱相同，看看谁跟谁更近。在那个时刻段，在吉林和黑龙江也有疫情，可是时令发现，来自北京新发地的序列和北京在3月份之前盛行的毒株、其时在黑龙江和吉林盛行的毒株都是不相同的，可是和在国外盛行，特别是在欧洲等地盛行的毒株骤变位点是相同的，阐明这个毒株不是来自于国内，而是来自于境外。那么境外是从哪儿来的？由于商场里边有两个货摊是售卖三文鱼的，其间S14货摊是自己在商场内切开，这两个货摊中的别的一个货摊没有病例，而S14货摊职工悉数感染，而且他们卖的收留中只要三文鱼是从境外进口的。”
为了进一步追溯感染的来历，科学家对三文鱼进行了检测。货摊在5月30号从前购入了一家公司的三文鱼，这个三文鱼是从境外进口的。对商场内一切的三文鱼的供货商库房的3000多份三文鱼进行了检测，发现有6份是阳性，而其间5份是来自X公司。由于5月30号S14号货摊购入的三文鱼现已卖完了，所以很惋惜，无法得到鱼的样本。可是科学家从一份没有开封的鱼体外表，经过测序得到了掩盖55%的基因组序列。经过比对发现这个序列，和前面在新发地测得的盛行毒株的序列是共同的，也有这些相同的基因骤变的位点。“所以这就提示，虽然时令由于样本原因没有别离到这个病毒，无法证明它的感染性，可是能够提示进口的冷链食物或许是病毒的传达载体。这也是榜首次提出了这样的一个发现。随后在国内多个区域也都发现在冷链食物外表检测出新冠病毒核酸，而且我国疾控中心在青岛在冷链食物的外表别离出新冠病毒。所以这也从另一个方面提示冷链食物在新冠病毒传达中的重要性。”
在新发地新冠病例的溯源中，宏基因组技能发挥了巨大的效果。
王健伟表明，近年来，高通量的宏基因组测序技能逐步得到了使用，而且发挥了重要的效果，特别是在病原体的确诊傍边，发挥“一锤定音”的效果。宏基因组技能用于病原体的检测有许多的优势。一是和PCR这些序列依靠的办法比较，它对错序列依靠性的，所以不需求预知任何病原体序列信息就能够进行检测。二是病原体检测的灵敏度比较高。三是检测的通量高，能够一起检测上万种病原微生物的物种，也能够发现或许的共感染。四是检测效能高，经过一次测序就能够拼接出病原体的基因组序列，不需求再重复进行试验。五是解析的深度深，能够一起剖析病原体的变异和耐药等状况。最终，它获取的信息全，除了获取病原的序列之外，还能够一起获取宿主的基因组和转录组的信息，为预警和临床治疗供给根底。
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