变异病毒的出现和扩大传播，被认为是印度疫情暴发的另一因素。其中，在印度首先发现的“双突变”变异新冠病毒B.1.617被媒体广泛讨论。据印度卫生部3月底发布的公报，由10个国家实验室组成的“印度新冠病毒基因组学联盟”，在马哈拉施特拉邦采集的样本中发现一种新的变异病毒，携带E484Q和L452R突变，可能导致免疫逃逸和传染性增强。全球流感共享数据库数据显示，该数据库最早在2020年10月就收到B.1.617样本的测序结果。这意味着，在疫情放缓的几个月里，印度政府错过了变异病毒测序的时机。
印度疫情仍可能“被严重低估”
与去年第一波疫情相比，印度公共卫生基金会流行病学教授吉里达尔·巴布认为，目前这一波疫情传播速度更快、年轻感染者占比明显上升。巴布预计，印度全国疫情可能到5月底才能达到峰值。
世界卫生组织首席科学家苏米娅·斯瓦米纳坦4月26日接受美国有线电视新闻网采访时表示，印度当前报告的新冠肺炎确诊病例数和死亡病例数“被严重低估”，实际感染人数可能比官方报告数字高出20倍至30倍。印度著名病毒学家雅各布·约翰博士也对德国之声表示，印度新冠死亡患者登记系统非常不完善，政府无法有效统计农村地区的疫情数据，现有监测系统也无法追踪医院之外的死亡人数。
印度此次疫情失控背后的更多潜在风险因素，也逐渐暴露出来。
印度中央政府目前并没有像去年那样在全国范围内实施封锁，莫迪曾明确表示不会再次实施“封国令”。除了缺乏统一的防控政策，德里甚至还出现了联邦政府与地方政府互相指责，导致氧气工厂建设计划被迫拖延。类似的协调困难也出现在氧气运输和医药供应等环节，导致印度目前出现“一药难求”现象。
印度接种新冠疫苗进度严重滞后。莫迪今年1月就发起了为13亿印度人接种新冠疫苗的计划，但印度卫生部截至4月28日的最新统计数据显示，印度迄今仅接种了大约1.47亿剂疫苗，远远不足以形成“群体免疫”。
更令人担忧的是，随之而来的可能是经济崩溃和社会危机。据彭博社4月25日报道，今年以来，印度政府为刺激经济而发行的债务规模将近1620亿美元，央行已将基准利率维持在历史低位，只能依靠非常规政策工具维持借贷成本稳定。如果需要更多资金应对第二波疫情，印度可能被迫发行更多债务，进一步给国债收益率的稳定性带来压力。印度经济再度站在失衡边缘，随之而来的民众生计危机和中小企业损失加重，将给印度社会带来更大的不稳定风险。
