凌烟阁二十四功臣中唯二被李世民下令处斩的就是侯君集和张亮，其中侯君集被处斩的时候，他的画像刚刚被放进凌烟阁不过月余，世间万事就是如此的无常，李世民当时还悲痛地说："与公长诀矣，而今而后，但见公遗像耳！"
作为开国功臣、凌烟阁二十四功臣之一的侯君集为什么走到了被处斩、被抄家的地步呢？原因就在于侯君集曾试图帮助李承乾谋反。虽然谋反事件还没有开始就被发现了，但是侯君集参与该事件的证据还是被发现了，更何况还有自己亲女婿的揭发，所以就成了板上钉钉的事情。
侯君集走到这一步，与他自己恃功而骄有很大的关系，侯君集虽然是一个武将，但在后期还是做到了出将入相，也算是人生赢家，但是人往往做不到善始善终。他的前半生走得很好，在隋末的大混战中，他跟随李世民南征北战，后来又成为玄武门之变的五大功臣之一，成为李世民信任的武将之一，等李世民登基后，侯君集开始参预政事，真正算得上是出将入相，在对外的战争中，侯君集也一直有参与，攻灭东突厥、攻破土谷浑都有他的身影，而魏征也曾向李世民推荐让侯君集为相。
可以说，这一时期的侯君集是春风得意的，但是他人生的转折点出现在639年，这一年，李世民让侯君集领兵攻打高昌国，而侯君集也 不负众望的将高昌国给灭了，但是在攻灭高昌国的过程中，侯君集却犯了几个错误：未奏请就配没无罪人，私取高昌国宝物，纵容部下盗窃宝物。
所以等侯君集班师回朝后，等着他的是牢狱之灾，不过岑文本认为不能轻易屈辱功臣大将，所以请求将侯君集放出来，李世民也认为侯君集功大于过，于是将其放出来，但是这件事还是在侯君集的心里埋下了怨恨的种子，在之后的几年时间里，侯君集对于李世民是有不满的，他甚至还在张亮面前说过想反了的话，至于是气话还是真话，我们不得而知。
不过在太子李承乾想要谋反的时候，李承乾的确和侯君集接触过，而侯君集也表示自己愿意助太子一臂之力。两人之间的往来是通过侯君集的女婿来沟通的，也因为这样，在太子谋反案被提前发现的时候，侯君集被自己的女婿给卖了。于是侯君集就被下了狱，然后被处斩，籍没其家。
侯君集在临死的时候，希望李世民能够赦免他的一个儿子，于是李世民下令将侯君集的妻子和一个儿子赦免，只是将两人流放到了岭南。在抄家的时候，从侯君集家中得到了不少好东西，金银珠宝自不必说，还发现了两个美人，《资治通鉴》记载：“籍没其家，得二美人，自幼饮人乳而不食。”
这个记载引自集贤殿学士刘餗的笔记小说《隋唐嘉话》，《隋唐嘉话》虽然只是笔记小说，但是在史料方面还是颇被后人重视的，里面的许多记载都被纳入了正史中，本身刘餗就在天宝年间 兼修国史，用他自己的话说，《隋唐嘉话》就是“不足备之大典，故系之小说之末。”在史料之余，添加了文学的成分，因此小说中部分被纳入正史，另一部分并未载入。
就比如这两个食人乳的美人，两唐书中并没有将这个记载纳入，但是《资治通鉴》却将其载入了。《隋唐嘉话》中对于侯君集的记载有五个小故事，其中两个涉及到了侯君集的反心，李世民让侯君集跟着李靖学习兵法，侯君集认为李靖藏私，于是告到了李世民那里，说李靖有反心，而李靖则说教给侯君集的那些兵法完全能应付当时代的战争，侯君集想学的更多可能有反心。而且李靖曾对着别人说侯君集将来一定会反。
再有三个记载就是太子李承乾意图谋反案发后的事情，其中一个就是侯君集希望李世民赦免他的一个儿子，另一个就是发现了侯君集私藏的高昌国宝物：金簟。还有一个就是发现的两个食人乳的美人。
