击溃陈友谅进攻应天府的大军后，同年十二月，朱元璋派博士夏煜、陈显道正告方国珍：“福根据诚恳，祸生于反覆，隗嚣、公孙述故辙可鉴。大军一出，不行虚辞解也”（《明史·列传·方国珍》）。
方国珍听后脸上显露一副不知所措的姿态，对使者好言谢罪。第二年三月，方国珍派人给朱元璋送来“金玉饰马鞍辔”，朱元璋没要。
方国珍为什么承受元朝的封赏而回绝朱元璋呢？
首要，刘福通的三路北伐军相继失利，朱元璋遣使与察罕帖木儿通好，元顺帝派张昶招降朱元璋。
刘福通的三路北伐军各自为战，没有连成一片，无法彼此援助；在元军的张狂反扑下，相继失利。元至正十九年（公元1359年）八月，元将察罕帖木儿攻破汴梁。关于朱元璋而言，东西双面张士诚、陈友谅凶相毕露，构成夹攻之势，一旦失掉北方红巾军的保护，将三面受敌，境况适当困难。为了缓解这种窘境，朱元璋差遣使者向察罕帖木儿通好。元至正二十一年（公元1361年）八月，察罕帖木儿占领山东，朱元璋再次差遣使者向察罕帖木儿示好。
察罕帖木儿把朱元璋两次遣使通好之事上奏元廷，元顺帝有意招降朱元璋，所以派户部尚书张昶帆海来到庆元，方国珍先后两次派人奉告朱元璋，均未得到答复。张昶在庆元住了一年，方国珍忧虑祸及本身，把张昶送到福建平章燕欠不花那儿。燕欠不花差人到建昌，请王溥代为转达。
至正二十二年（1362年）六月，察罕帖木儿攻击益都时遇刺身亡。
应天保卫战之后，在与陈友谅的对战中，朱元璋相继霸占江州、蕲州、安庆等地，陈友谅的地盘日益减少；陈友谅的部将傅友德、丁普郎，吴宏、王溥、胡廷瑞等人相继来降。
元至正二十二年（公元1362年）十二月，朱元璋派人将张昶接到应天府，清晰表明不会屈服元朝。
其次，一旦回绝元朝的封赏，方国珍很可能遭受张士诚和元军的夹攻。
张士诚其时已屈服元朝，方国珍与其领地相交，并且有旧隙。再者，方国珍操控海运，海路其时是江南与大都的仅有运送通道，元朝不会坐视海运的操控权落于别人之手。
