袁崇焕不大厚道的是还想让毛文龙以辽东镇江(丹东)为陆基，直面后金兵锋，为什么说不厚道呢，和送死没区别，不同于己巳之变的依城反击，真正大规模长期野战无论毛文龙还是袁崇焕都没戏。
早在天启元年毛文龙就曾有过所谓的“镇江大捷”，但那是偷袭而已，后金部队一反击，毛文龙立刻就跑到朝鲜去了，真心打不过，如果毛文龙按袁崇焕的计划去做，必死无疑，打打不过，真正被包围逃逃不出，被围死没人有能力来救，逃皮岛逃朝鲜?打一次跑一次呀，开玩笑。
这一系列作为让毛文龙直接撕破脸，带着40船士兵到登州索饷，其实谁都不敢给，毛文龙也知道，他只是示威而已，气急之下说的也很过分，又是拿下朝鲜，又是拿下南京的，在那年代，这话论个死罪很正常。
眼看毛文龙“翻坑”，这个节骨眼上袁崇焕虽耿耿于怀，但却不敢直接弹压，只能尽力筹措粮饷，实则当时已动杀机，因为不光如此，在见面会上二人也是不欢而散，袁崇焕想大权独揽，但有毛文龙在至少东镇是别想了，而且毛文龙虽然牵制作用极大，但拿得出手战功太少，和他靡费的钱粮相比不成比例，至少当时的崇祯和袁崇焕是这么想的。
后来袁崇焕双岛之行，二人再生嫌隙，毛文龙早就因为袁崇焕的掣肘而不满，在饭局上直接抱怨小人作祟，若是一切军备物资能够到位的话，让他出力并不困难，到了晚上的酒局，袁崇焕夸崇祯，毛文龙夸天启，袁崇焕说收复辽东，而毛文龙说宁远都是废物，东江将士几千人就能烧了东夷。
以后几次交谈，甚至聊到深更半夜也都是无果而终，最终袁崇焕劝退毛文龙，让他去西湖养老，毛文龙不从，因为这是必死之路，但袁崇焕却说朝廷自有替代你的人，结果还是不欢而散。
对于袁崇焕要求毛文龙接受自己节制、整肃军营核查人数、设立饷司的要求，毛文龙一口答应，但是没想到袁崇焕真的想直接架空他，马上反悔，袁崇焕又退一步以旅顺为界，各行政令，并说自己马上要返回宁远，毛文龙听后大喜，以为最终还是个不了了之的结局。
但毛文龙所没有想到的是，袁崇焕又是赏银十万，又是分界自治，又是要回宁远，其实只是让毛文龙降低警惕，看到一切均以奏效，所以邀请毛文龙岛山一行，结果毛文龙进了袁崇焕官兵的包围圈，自己人并挡在营外，袁崇焕历数毛文龙十二罪状，毛文龙不愿认罪伏诛，但袁崇焕则说不杀你，这东江便不是皇帝的土地，遂令部下将毛文龙斩首。
这是过程，由字面来看，毛文龙主要是不肯放权，而且拒绝监管，包括核查兵员等等，前文讲过，毛文龙放权的话只能一死，说是杭州养老，其实回到内地满朝文武弹劾之下，崇祯也抗不住，更何况崇祯也早就看毛文龙不顺眼了。
袁崇焕看毛文龙不顺眼主要是因为毛文龙对自己海陆集权的掣肘，听调不听宣的模式无论崇祯还是袁崇焕都无法接受，毛文龙掣肘后金的作用毋庸置疑，否则皇太极不会听说死讯后行祭祖大礼，但是毛文龙尤其在收复失土的作用方面，崇祯和袁崇焕都认为其发挥的不够，而在东江消耗的财力、物力却实在惊人。
袁崇焕以往的承诺自己也开始怀疑是否能达成，而那时的崇祯也不再相信袁崇焕了，只是不想自打耳光而已，己巳之变的发生让崇祯及时止损，不再一味奉行所谓的筑城推进计划，一是没有能力在后金强兵之下再行修筑之事，二是按当时的明廷财政来看，根本支撑不起，最终被弃用的袁崇焕，他的大罪中也多了一个谋款斩帅，算是一命还一命吧。
可惜袁督和毛帅生在那个年代，又遇上崇祯这种皇帝，所以下场可想而知，用人的时候别人说什么信什么，恨不得跪下磕一个，短时间内反复后，则恨不得生食其肉，属于抽搐型性格，仨人都是时代的悲剧，但说实话，死得都不冤，一点都不冤，那个年代有那个年代的规则和法律，袁崇焕擅杀毛文龙这是死罪毫无争议，别的罪名甭提，一条就够了。毛文龙别的罪名不提，听调不听宣就够死罪，也不用提别的，所以单按罪名来说，死的都不冤，崇祯帝，真懒得说，他不死就没天理了。至于权衡之道的争论，正反两方是一辈子都掰扯不清楚的。
