轩辕庙，也称黄帝庙，坐北朝南，最早建于汉代，占地约9.33公顷。庙院长140米，宽84米。主要建筑有庙门、诚心亭、碑亭和人文初祖殿。院内有古柏16棵，最珍贵者当属“黄帝手植柏”与“汉武挂甲柏”。庙址设在桥山之麓。唐代正式将祭祀活动列为国祭，并开始重修扩建黄帝陵庙。
“朕生后世，为民于草野之间；当有元失驭，天下纷纭，乃乘群雄大乱之秋，集众用武。荷皇天后土眷佑，遂平暴乱，以有天下，主宰庶民，今已四年矣。君生上古，继天立极，作涿裰鳎，神功圣德，垂法至今。朕兴百神之祀，考君陵墓於此，然相去年岁极远;观经典所载，虽切慕於心，奈禀生之愚，时有古今，民俗亦异。仰惟圣神，万世所法，特遣官奠祀修陵，圣灵不昧，其鉴纳焉！尚飨！”
从这篇“祝文”中，我们能感受到朱元璋诚恳的态度，相比于那些歌功颂德的祭文，朱元璋的“祝文”可谓十分“接地气”。
不过，朱元璋为何要写这样一篇文章呢？他为什么要祭祀黄帝呢？
我们知道，朱元璋发迹前，他的家庭条件非常困难，家人全部饿死在饥荒中，只剩他一人孤苦伶仃浪迹天涯。为了混口饭吃，老朱不得不剃光头发当和尚，靠做杂役换来斋饭填饱肚子。后来，各地天灾频发，庙里的存粮不足，寺主只能遣散了所有和尚，让他们自求多福。走投无路的朱元璋，只能来到大街上，行乞度日。
在朱元璋二十五岁那年，全国刮起了一阵抗元的浪潮，老朱投靠了实力强劲的红巾军头目郭子兴，吃上了军粮。没过多久，朱元璋便在义军中崭露头角，成为这支队伍里的中坚人物。郭子兴过世后，朱元璋接过抗元的重担，以领袖的身份接管了郭子兴麾下的将士。公元1356年，老朱夺取了集庆，在此地建立政权。
之后，为了逐鹿中原，朱元璋效仿高祖“高筑墙，广积粮，缓称王”的方针，发展农业生产，招募士兵，暗中积蓄实力。用了几年时间，朱元璋终于打下了半壁江山，控制了长江中下游地区。时机成熟后，朱元璋在群臣的簇拥下登基上位，建立了属于自己的大明王朝。由于，老朱出身草根，他的肚子里自然没有多少墨水，所以，他的皇帝职涯是在摸索中一点点探索前进的。
通过学习古代皇帝的经验，朱元璋发现：以前的所有“同行”都会祭拜黄帝。说起来，各行各业都有祭拜祖师爷的传统，皇帝这行也不例外。黄帝（公元前2717年-公元前2599年）是古华夏部落联盟首领，更中国远古时代华夏民族的共主。其统一华夏部落与征服东夷、九黎族而统一中华的伟绩载入史册。所以，在老朱的眼里，祭祀黄帝就像是皇帝这一行的“行规”，是统治生涯中必不可少的环节。
就此，朱元璋于洪武四年向文武百官提出祭祀黄帝的想法。
当时，一块与老朱一块打天下的老哥们在背地里悄悄谈起此事，纷纷表示：“重八居然还知道黄帝。”议论归议论，如今的老朱已贵为一国之君，这些话当然不会被他知晓。虽说，朱元璋有心祭拜“祖师爷”，不过，他的文笔有点糙，写不出赏心悦目的祭文。无奈之下，朱元璋只能让大臣先草拟一份祭文。
大臣的祭文写好后，朱元璋读后觉得不大满意。老朱觉得，自己在登基四年后才想起祭拜黄帝，已经是一件非常丢面子的事了，若祭文写得马马虎虎，后人必会嘲笑自己是个不懂规矩的草根皇帝。在这篇祭文中，除了要写明自己的功绩外，还得留下自己四年未祭拜轩辕陵的理由。
因此，朱元璋修改了祭文，在文中诚恳地表示：
“朕出身草莽能够取得江山已是万幸，这都是祖先降下的福泽。不过，因轩辕陵年深日久朕始终无法找到黄帝陵的地址，用了四年时间才从经典著作中找到蛛丝马迹，这才耽误了祭奠。虽说朕的祭奠迟来了四年，但朕的心中始终记挂着先祖，希望先祖能够继续庇佑老朱家的基业，保大好河山长治久安。”