拥有如此尊贵身份的她，出身也不平凡。公元569年，北周定州总管神武公窦毅与北周襄阳长公主生下了一位千金，小女孩刚出生时，头发就又黑又长。到了3岁，窦氏头发已经长到了跟身高一样，相貌也十分不俗，智商极高，能过目不忘。，
北周武帝宇文邕听说外甥女不同凡响，接到皇宫中亲自教导、抚养，对待窦氏像亲生女儿一样。
窦氏五六岁岁的时候，发现皇帝舅舅跟皇后舅妈（皇后阿史那氏）关系不好，于是她私下劝舅舅说：“舅妈是突厥人，为了国家之间的和睦，也请您对她更好一点。”宇文邕认为窦氏说的很对，于是转变了对待皇后的态度，也因此更加喜欢外甥女窦氏。
公元578年，宇文邕驾崩，窦氏哭泣的非常伤心，周边的人都被她所感动。后来窦氏出宫回家，才短短三年后，杨坚就篡夺了北周的江山。十几岁的窦氏异常愤恨：“可惜我不是男子，不能去为舅舅家出力，挽救大周江山社稷”（恨我不为男，以救舅氏之难）。窦氏的父亲窦毅赶紧捂住她的嘴：“孩子，切不可乱说，这可是要灭门的大罪啊。”
虽然制止了女儿，但窦毅心里却暗暗为她叫好，认为女儿不一般。窦氏到了出嫁的年纪，窦毅特意想出个办法选女婿来配自己的掌上明珠：在一张图上画一只孔雀，可以百步之外射中孔雀眼睛的人方可娶到窦氏。最终，李渊射中了孔雀的两只眼睛，成为了窦毅的乘龙快婿。
窦氏嫁给李渊后，二人感情很好，他们生了四子一女：李建成、李世民、李玄霸、李元吉、平阳公主。窦氏还曾规劝李渊不要私藏好马，应该献给有这种爱好的隋炀帝，李渊因没有听劝告还被贬官。
公元613年，窦氏去世，公元618年李渊称帝，第一件事情就追封窦氏为穆皇后，并终生再没有立皇后。
贞观九年五月九日，其子李世民追尊她为太穆皇后。天宝八载六月十五日，唐玄宗追尊她为太穆顺圣皇后。
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