日本是有孔庙的，规模还挺大，日本也是全世界唯一一个在中国之外供奉孔子的国家。这也充分说明了孔子儒家文化对东亚地区的巨大影响。日本、韩国、朝鲜三国一直以来都与我国有着千丝万缕的联系，最为明显的证据就是他们的文字都有我们汉字的影子。日本早在唐朝时期就大量的派遣使者来我国取经，并带走大量的书籍、先进的技术、优秀的文学艺术等。而儒家文化的中心思想和政治体制也逐渐的被日本吸收和利用。
1931年918事件爆发，日本发动了侵华战争，1937年，卢沟桥事变爆发，日军的侵华战争全面打响。不久铁蹄踏上了齐鲁大地，日本军部给侵华日军下达了一道死命令''山东战争中不得破坏曲阜孔庙及其它古迹，如有违抗者严惩不贷。''侵华日军司令部立刻下令军队避免在曲阜周边地区发生战斗。日军进驻曲阜后，马上派人对孔庙进行保护，日军组织团以上将领专门前去参拜。当地县志记载，日军到处鞠躬行礼，进入县衙发现墙上有孔子像也鞠躬致敬。当地一个老百姓跟日本人发生纠纷动手后跑进了孔林，日军不敢闯进去，只好对天射击。
要讲日本冲绳县的孔庙，我们就要回溯到琉球王国时代，定格于明清那段历史。琉球建造孔庙的历史比较迟，但是跟中国的孔庙很像，遵循各种中原礼节。话说，明太祖朱元璋的时候，琉球就派贵族子弟来到南京国子监学习。他们不仅学到满腹经纶，而且尊奉“儒学之地皆立孔庙”，于是琉球就有了最早的孔子像。不过，琉球早期的孔庙还是不上档次，只是简单的祭祀。到清朝康熙年间，具体是1671年，琉球国主尚贞王，命令在那霸建立大型孔庙。这座那霸的孔庙，分为大成殿、明伦堂等建筑，平面图如上。
祭孔在古代是规格很高的典礼，一般是由天皇或者天皇的委托人为主祭人，但后来天皇成了摆设，没有实权，朝政大权都在幕府将军手上，但幕府将军只是“臣”，不是“君”，天皇没有实权，无法真的去主祭，幕府将军有权而无名，他没有资格去主祭，最后像汤岛圣堂的祭孔大典，居然就成了没有主祭人，只有致祭人，即由孔庙的负责人奉命致祭，至于奉谁的命，一般是模糊过去。这种情况本身就违反了儒家尊君的理论。