不得不说，若佟养性没有彻底倒向后金，以他此时的身份，突然倒戈，对后金将会是毁灭性的打击。然而，作为女真人，佟养性最终还是站在了明朝的对立面。
佟养性在满洲管理汉军，监造大炮，地位隆崇，然而，正在他处在“事业巅峰”的时候，他却病逝了。《清史稿》记载，佟养性死于天聪六年（1632年）。此后，他的堂兄佟养真接过了佟氏一族的大旗。清军入关后，佟养真把自己的孙女佟佳氏送到宫中做顺治的妃子，后来，佟佳氏生下一子，取名玄烨，也就是后来的康熙帝。佟养真的儿子佟图赖、佟图赖之子佟国维、佟国维之子隆科多都是清代权臣，他们把持朝政多年，清朝的“佟半朝”，就是由此而来。
站在清朝的角度来说，佟氏一族为后金和满清立下不世之功，佟养性的“双面间谍”身份被彻底洗白。站在明朝的角度来说，佟养性被列为“头号叛徒”，因为他一人，让明朝损失惨重。
明朝、清朝都是中国历史的一部分，在两朝交替阶段，总有一些人要选边站队，佟养性的功过是非，不能一概而论。
