顺治八年(1651年)多尔衮死，顺治帝亲政，收多尔衮所辖的正白旗归皇帝统领，于是形成了上三旗与下五旗。镶黄旗、正白旗、正黄旗为上三旗，由皇帝亲自统领，其余五旗为下五旗。随着中央集中权力统治的加强，后来八旗全都由皇帝亲自掌管。
清入关伊始，为加强军事防御，分别令八旗兵在京师与各地驻防，直至18世纪中叶，八旗营区终于系统地分布于全国的军事要地，实行永久性的驻扎。
5.旗主的官有多大？
在电视剧《铁齿铜牙纪晓岚》里面的有这样一幕，和珅在兰州的时候，因为没给金爷的面子，最后被金爷羞辱一番，按照金爷的说法就是“即使我做乞丐，和珅见了我也得亲自下来给我磕头！”金爷在剧中的背景就是正红旗的旗主，恰好和珅又是正红旗出身。那么满清时期的八旗旗主真有这么大的权力吗？他们的官职有多大？
满清八旗有着严格的等级制度，他们不论你是谁，担任什么职务，哪怕是一品官员，只要你还属于旗人，见到旗主就必须叩头，这样看来，八旗旗主的官职应该是高于一品的。
在八旗中，旗内官职最高的是都统，官居从一品，主要负责一旗的人数、教养以及官爵承袭还有军事方面的训练等，都统的位置已经很大，但还是不如旗主，因为都统也得听旗主的，旗主都是代传罔替的铁帽子王。如此便能看出八旗旗主的官职地位有多高了。
6.皇帝、皇子和旗主的关系
总的来说，一般上三旗是有皇帝直接控制，下五旗则基本上是由贵族控制，一般来说都是亲王或者贝勒，这些人的身份本来就高，如果再担任了其中一个旗的旗主，那地位更加显赫，早已经高于普通的官职了，应该算是大清王朝时期核心统治阶层的核心人物。
最早这八旗旗主都是由努尔哈赤和他的儿子或侄子担任，要知道八旗是一个集合了人口、军事力量和财产的一种共同体，在早期，皇帝虽然是最高领袖和统帅，但实行的是分封制，把八旗人口按牛录封赏给皇子和宗室王公，附着在人口上的土地、财产，都成为这些皇子和宗室王公的私人财产产或私人附属。
在清代初期，当时的旗主不是皇帝本人，就是自己的儿子、孙子或侄子！这些旗主的权力非常大，地位仅次于皇帝。事实上，当时的皇帝本人也是旗主，只是最大的旗主而已。清代早期的军国大事都需要皇帝和八旗旗主共同商议，共同裁决，皇帝本人并没有乾纲独断的特权，但慢慢的随着旗主王爷的更换和权力的增加，他们和皇帝的分歧越来越大，导致政令不统一，于是就有了顺治皇帝一人统领正黄，镶黄和正白三旗，即所谓的上三旗，并慢慢削弱其他五个旗主（下五旗）的权力和地位！
到了康熙皇帝时，下五旗的旗主虽然都是爱新觉罗宗室亲贵，但血缘和亲情已经疏远，为了控制下五旗，康熙就把自己的皇子阿哥们分到下五旗，如大阿哥胤褆，二阿哥允胤礽，三阿哥允胤祉分到镶蓝旗，四阿哥胤禛等分到镶白旗，八阿哥胤禩，九阿哥胤禟，十三阿哥胤祥分到正蓝旗，这样一来给人的感觉是康熙皇帝在作贱自己的皇子，把他们送下五旗的旗主做奴才？
一向圣明无比的康熙皇帝哪里会做这样让人笑话的事，虽然下五旗的旗主是铁帽子王爷或亲王郡王，但康熙的皇子也不简单，大阿哥胤褆是直亲王，二阿哥胤礽更是太子储君，三阿哥胤祉是诚亲王，四阿哥胤禛是雍亲王，八阿哥胤禩是廉亲王，他们是皇子又是亲王，虽在下五旗但地位也不比旗主王爷低，再说康熙皇帝在把皇子分到下五旗时，同时还赏赐给他们很多牛录和佐领，如雍正皇帝在当雍亲王的时候，就被封到了镶白旗，镶白旗的旗主王爷是肃亲王，肃亲王掌管15个佐领，而雍亲王在镶白旗则要掌管了10个佐领，相当于小旗主，自然地位不会低于旗主。
