明亡，清树立后，虽改朝换代，但“庶吉士”的准则仍旧被清廷所沿袭，“顺治三年，世祖始策贡士於廷，赐一甲三人傅以渐等及第，简梁清宽等四十六人为庶吉士”(《清史稿.推举志》)，顺治三年，清朝开端从进士中选拔庶吉士。不过清尽管依然是沿袭庶吉士准则，但在细节上同明朝有些较大的改变。
首要，在清朝，庶吉士虽也是依才能来进行选拔，但却有了约束，“(顺治)九年，以给事中高辛允言，按直省巨细选庶吉士。直隶、江南、浙江各五人，江西、福建、湖广、山东、河南各四人，山西、陕西各二人，广东一人，汉军四人”，自顺治九年开端，庶吉士的选拔已各省的巨细来进行人数约束，其间直隶、浙江、江南(安徽、江苏)5人，江西、福建、湖广、山东、河南4人，山西、陕西2人，广东1人。也便是说在殿试后，比方浙江籍进士充当庶吉士的最多五人，而陕西籍进士则最多2人。
再是清初，庶吉士并不归翰林院办理，而是归内翰林宏文院办理，《清史稿.职官志》载：“庶吉士旧隶内弘文院，后设本院，始来属”。直到顺治十四年(1657年)，顺治重设翰林院，由此庶吉士再次归翰林院办理的。尔后，康熙年间，庶吉士的被管辖权曾历经数次的变化，直到康熙九年(1670年)，庶吉士归翰林院办理才成为定制。
其次关于“庶吉士”的选拔，清朝较之明朝更为的严厉。“(雍正三年)殿试后，集诸进士保和殿考试，仍令九卿确行推荐。考试用论、诏、奏议、诗四题。是为朝考之始”，自雍正三年开端，除一甲外，二甲、三甲进士要想被选为庶吉士，则需再经过一场考试，即由皇帝亲身举办的“朝考”。“殿试传胪后三日，于保和殿举办进士朝考，专为选庶吉士而设”，朝考举办的时刻就在殿试传胪第四天，这一天皇帝会亲临保和殿，对二三甲进士进行查核。
尔后，朝考经过者就可为“庶吉士” ，其他则实授六部主事、中书、知县等职。
最终，相关于明朝，清朝多了一个特有的“庶吉士”，那便是“翻译庶吉士”。当然此“翻译”非彼“翻译”，它指的是从清朝科举考试中特有的“翻译科”中发生的“翻译进士”所选拔而出的“庶吉士”。
“翻译科”是清朝科举中为八旗特设的一个考试科目，仅限满蒙汉军之八旗子弟参与。“翻译科”源于顺治八年，这一年顺治举办八旗乡试，专供“不能汉文者”的八旗子弟参与，当然顺治只举办了二届，之后并废弃。康熙初年，复行翻译乡试，史载：“骄傲、汉合试制举文，罢翻译科。雍正元年，诏八旗满洲於考试汉字生员、举人、进士外，另试翻译”。
当然康熙年间，翻译科是时废时置，不成定制，直到雍正登基时，因清朝控制华夏已过百年，此刻全国虽已牢牢被清廷所控，但从前惟我独尊的八旗却日渐迂腐，文武皆不可，因而朝堂上汉人的实力开端模糊有压倒满人的预兆。所以为了充分满人执政堂上的力气，雍正皇帝开端正式推广“翻译科”这一为八旗子弟特设的科举考试。
“翻译科”参照“进士科”的科举考试，顺次设有童试、乡试、会试、殿试四级。当然在实际上的运转中，“翻译科”并无殿试，只需童试、乡试、会试三级，而之所以会省去殿试，最重要的原因便是应考的八旗子弟缺乏，“然会闱自五十三年讫嘉庆八年，仅一行之，犹缺乏定例六十名之数”，乾隆五十三年至嘉庆八年，参与会试的八旗子弟缺乏六十人，因而原本能经过会试的就很好，假如再举办殿试，恐怕能被选取的八旗子弟会愈加少。
如此，清朝历代皇帝大都都因而而废弃殿试，如乾隆四年(1739年)，乾隆下诏：“本年翻译会试……此科人数甚少，不用举办殿试，俱著赐进士身世”，即不举办殿试，只需经过会试就即可为进士。
当然在道光之前，“翻译科”是没有充当庶吉士的先列的，其时清朝皇帝选庶吉士只从“进士科”选出，而不会从“翻译科”选出。“道光八年，罢翻译同考官，末年始有用庶吉士者”，直到道光二十七年(1847年)，道光下旨：“因思翻译为满洲本业，均应随时学习精熟……升途较隘。若将此项人员转入翰詹衙门，令其专注学习翻译”，尔后清廷才有了从“翻译科”选拔庶吉士的定制。
