皇太极去世后，多尔衮想接替他做皇帝，但是皇太极的长子豪格也想做皇帝，两人随即因为皇位展开了争夺。同时，满洲八旗中的两黄旗，害怕丢失它们上三旗的地位，也反对多尔衮做皇帝，最终在豪格，以及鳌拜、索尼等两黄旗大臣的反对下，多尔衮没有做成皇帝，但是他因为扶持之功，做了福临的摄政王。
多尔衮又找机会，扳倒了和他同做摄政王的济尔哈朗，这让他实现了大权独揽。随后，多尔衮开始了清除异己活动，豪格，以及反对他的鳌拜、索尼等两黄旗大臣，成了多尔衮的重点打压对象。
豪格是镶蓝旗旗主，手握重兵，所以他是多尔衮的眼中钉肉中刺，对多尔衮威胁很大，多尔衮做摄政王后，以豪格曾言语中伤自己，将其议罪并削爵。但是大清入关后，豪格又因平定中原有功，恢复了原封和硕肃亲王。同年，豪格又平定山东济宁满家洞的土寇，建立了赫赫功勋。
顺治三年，豪格被清廷任命为靖远大将军，率兵西征，他平定了张献忠等农民起义军，帮助满清拿下了西北，但是豪格班师回朝后，就被多尔衮以隐瞒其部将冒功、起用罪人之弟的罪名下狱，随后，豪格被多尔衮害死在了监狱中，年仅四十岁，直到多尔衮去世后，顺治才给豪格平反。
相对于豪格，索尼和鳌拜的结局略微好一些。
反对多尔衮的两黄旗八大臣，在多尔衮得势后，拜音图、何洛会、谭泰和冷僧机4人倒向了多尔衮，并告发图赖、图尔格两人说多尔衮坏话，导致图赖、图尔格被清廷削去宗籍，贬为庶民。图赖、图尔格失去权势后，对多尔衮没有威胁了，多尔衮也就放过了他们。索尼和鳌拜因为功勋多，威望高，为人正直，不肯向多尔衮屈服，也没有把柄，所以多尔衮不容易除掉他们。
多尔衮做摄政王之后，免了索尼启心郎的职务，但仍然让索尼管理六部，不过多尔衮虽然不满索尼，但是也找不到处理索尼的理由。后来索尼被人告发将内裤的漆琴赠予了他人，多尔衮才以此为借口，削去了索尼爵位。顺治五年，贝子屯齐告发索尼在皇太极去世后，和图赖等人准备谋立豪格为皇帝。多尔衮又在此事上大做文章，将索尼夺官抄家，让索尼去给先帝守陵。
多尔衮想处理索尼，但实际上，他找到的两个接口，将内裤的漆琴赠予了他人，是小事一桩，索尼支持豪格做皇帝，又是人尽皆知的一件事，都不足以治索尼于死罪，所以多尔衮只是夺了索尼的权势，让他远离权力中心，索尼对多尔衮构不成威胁后，多尔衮也就没有再继续打压索尼。
多尔衮对鳌拜的打压力度更强。顺治元年，阿济格私下称呼顺治为“孺子”，多尔衮下令将阿济格“称上为孺子”之语传示晓谕，鳌拜等人顾及英亲王情面，没有照办，多尔衮以此让鳌拜将征讨李自成的军功不准议叙，还罚银100两。随后，鳌拜又因庇护索尼，几次获罪并被革职。
顺治五年，鳌拜在征讨完李自成后，他手下因冒功邀赏被惩罚，鳌拜受牵连，议处“应革职，罚银一百两”。随后贝子屯齐告发鳌拜等人曾试图谋立豪格，鳌拜因此被判死罪，得旨"罚锾自赎"。四月，鳌拜又被人告发在皇太极死时"擅发兵丁守门"，再次论死，改革职为民，得旨免革职。短短数月月时间，鳌拜两次被判死刑，受到的打压不可谓不重，但鳌拜最后都因功逃过一死。
顺治七年，多尔衮又以"违令渎请"的罪名，追究鳌拜包庇之罪，论死，后改免死罚赎、降爵。多尔衮去世后，对鳌拜的打压才算结束。
多尔衮杀豪格，是因为豪格手握重兵，支持者众多，对自身的威胁很大，而索尼和鳌拜对自身的威胁有限。同时，大清刚进入关内后，正是用人之际，所以大将帮助他们对付李自成、张献忠，以及南明政权等反清力量，再加上鳌拜和索尼是两位功臣，多尔衮在罪名不充分的情况下，不敢随意杀掉他们，因为这可能会导致将领的不满，让功臣寒心，所以多尔衮在自身的地位不会受到威胁的情况下，基于大局考虑，不敢杀掉索尼和鳌拜这两位没有犯大错的功臣。