而清廷已经有了杀朱慈炯的先例，吴三桂害怕清廷再一次出尔反尔，随便找个理由将自己杀害，与其顺从朝廷撤藩也是逃一死，不如起兵造反，还有一线生机。
吴三桂想通过起兵洗白自己
吴三桂引清兵入关，扫平南明小朝廷，并绞死南明永历帝，遭到了汉人的唾弃，成为了汉人眼中的大汉奸。吴三桂希望举着反清复明的旗号，号召天下的汉人跟他一起，将满人赶出山海关，如果成功了，他不仅自己可以成为千古一帝，也会变成汉人眼中的英雄，彻底洗白自己。
然而，此时的清朝正处于蒸蒸日上的繁荣阶段，阶级矛盾已经不是社会的主要矛盾，天下的老百姓都想安居乐业，至于那个昏庸至极的大明朝，老百姓差不多都快忘记了，怎么还会跟着吴三桂起来造反呢？还有就是，此时的吴三桂已经是一个迟暮老人，无论是精力还是计谋，甚至兵力、财力都不是康熙皇帝的对手，他的造反必然会遭到失败。
当吴三桂起兵造反的消息传到北京，康熙皇帝坚定地认为对于反叛之徒必须予以消灭，不能作出任何退让。为了彻底粉碎吴三桂的幻想，康熙皇帝随之将吴三桂之子吴应雄抓捕到案，即使吴应雄的妻子，康熙皇帝的亲姑姑在孝庄皇后和康熙皇帝面前苦苦哀求，仍然义无反顾的将其处死，“以寒老贼之胆，以绝群奸之望，以激励三军之心”。
康熙二十年（公元1681）年，吴三桂的叛军与康熙皇帝苦战8年之久最终还是走向了覆灭，清军进入了云南昆明。吴三桂虽然已经死去，但是仍然被刨棺戳尸，其子孙也被斩尽杀绝。
