明孝宗朱祐樘
1.官员不得向皇帝乞职。成化年间，一些与皇帝比较亲近的人，包括外戚、宦官或其他官员等，经常会直接向明宪宗举荐人才，即主动跟明宪宗要官。明宪宗同意之后，又绕过朝廷，通过中旨直接任命官员，这就是成化朝比较常见的朝奉官。这些由皇帝个人喜好任命的官员不经过考核，其品性、才学通常会存在问题。最主要的是，越过吏部任命官员，违反了国家律法。王恕认为，如需要举荐人才，应到吏部举荐。
2.所有保举的官员必须参与吏部的考核。吏部应该对保举上来的官员，按照吏部的要求进行考核，通过考核之后才能任命或升迁。如不符合要求的，应该贬职或罢免。
明孝宗朱祐樘
3.推行保举连坐制度。对于保举上来的官员在任职后，如果出现不称职的情况或违法行为，保举人也会受到牵连，并对保举人进行处罚，严重的还要贬职或罢免。
王恕对保举制度的改革得罪了朝廷中很多大臣。明孝宗刚刚继位，就罢免了很多官员，朝廷之上出现权力真空。一些官员正在摩拳擦掌，打算通过各种手段，扶持或提拔自己的亲信官员，却被王恕所阻。
一些言官曾上书向明孝宗，称王恕年迈，不适合担任繁重的职务，应入阁参预政事。这建议看起来是好意，其实是想将王恕赶出吏部，明孝宗说：“我任王恕在吏部为官，自然要听从王恕的建议，何必让他入阁呢？”而后，一些言官就王恕曾提出的“在寒冬酷暑期间暂停御前讲席”的建议弹劾王恕。王恕压力太大，只能以请求辞官，幸亏明孝宗苦苦劝留。王恕也因此和内阁首辅刘吉发生矛盾。刘吉任首辅后，曾对此前弹劾过他的一些官员进行打击，王恕曾上疏极力相救。而对于王恕提拔的一些官员，刘吉也是百般阻挠。
明孝宗朱祐樘《明史》：时言官多称恕贤且老，不当任剧职，宜置内阁参大政。最后，南京御史吴泰等复言之。帝曰：“朕用蹇义、王直故事，官恕吏部，有谋议未尝不听，何必内阁也。”
对于宦官与外戚趁机保举的官员，王恕也会阻止。例如宦官李兴曾因主持修京城河的桥，向明宪宗提出升潘俊等官员的职位，这事本来已经得到明孝宗的同意，王恕却两次向明孝宗上疏规劝，明宪宗最终采纳了王恕的建议，没有给潘俊等人升官。
明孝宗朱祐樘
上任以后，王恕对捐监和保举两个选官制度进行改革，加大人才选拔和考核的力度，取得一定的成效。王恕掌管吏部前后近5年时间，也提拔了诸多人才，包括周经、李敏、耿裕、彭韶、何乔新、张悦等，都是当时的名臣。只是他也因此得罪了很多朝廷的官员，无奈之下曾多次打算引退，幸亏明孝宗对他万分信任，他对吏治的改革才得以进行。
