成为辅政大臣后，鳌拜和索尼很多时候看法一致，所以索尼也比较支持鳌拜，但是鳌拜渐渐变得张扬跋扈，擅权时，索尼已经年迈，没有精力和鳌拜斗争了，他为了避免和鳌拜较量，开始渐渐减少参与政事。索尼是个忠诚的大臣，康熙为了拉拢索尼，将他的孙女赫舍里氏娶为了皇后。
康熙这样做，将他和索尼家族捆绑在了一起。索尼自身没有精力和鳌拜斗了，所以他将希望放在了年轻一代身上，索尼让自己的儿子索额图辞去官职，入宫做了康熙的侍卫，保护康熙的安全。
索尼在去世后，他的儿子索额图为康熙训练了一批亲贵子弟，在鳌拜入宫没有防备之际，将鳌拜擒拿了。这也让康熙顺利除掉鳌拜，从他手中夺回了权力。从结局看，索尼的愿望也实现了。
