《诸病源候论》是我国现存第一部论说各科病证的病因、病机、证候内容的专著。关于本书的作者、成书年代及卷数，现在学术界的关键为本书由隋朝医官巢元方等撰写，成书于隋·大业六年（即公元610年）。全书共50卷，分为67门，1739候。
上述观念源于宋朝，而在宋代曾经的史志中，关于本书作者及卷数，则著录纷歧，故令后世歧说较多。最早编录本书的是《隋书·经籍志》，志载《论（当为“诸”）病源候论》五卷、《目》一卷，吴景贤（此医家《隋书·麦铁杖》中有载）撰。在《旧唐书·经籍志》中则为《诸病源候论》五十卷，吴景（当为“吴景贤”，吴景在《隋书》《旧唐书》中均无从考证）撰。而至《新唐书·艺文志》中则为《吴景贤诸病源候论》五十卷，与《巢氏诸病源候论》五十卷、巢元方撰，两书并存。至《宋史·艺文志》，则只要巢元方《巢氏诸病源候论》五十卷一种记叙，而无吴景贤或吴景撰写的《诸病源候论》记载。
关于以上史志中的不同记叙，《四库全书概要》云：“巢氏《诸病源候论》五十卷，隋大业中太医博士巢元方等奉诏撰。考《隋书·经籍志》有《诸病源候论》五卷，《目》一卷，吴景贤撰；《旧唐书·经籍志》有《诸病源候论》五十卷，吴景撰。皆不言巢氏书。《宋史·艺文志》有巢元方《巢氏诸病源候论》五十卷，又无吴氏书，惟《新唐书·艺文志》二书并载，书名、卷数并同。不该如是之相复，疑其时本属官书，元方与景，一为监修，一为撰写，故或题景名，或题元方名，实止一书，《新唐书》偶尔重出。观晁公武《读书志》称隋巢元方等撰，足证旧本所列不止一名，然则《隋志》‘吴景’作‘吴景贤’，‘贤’或‘监’字之误。其作‘五卷’，亦当脱一‘十’字，如止五卷，不该目录有一卷矣。”即言《诸病源候论》是隋朝官府安排编写的医著，由巢元方和吴景（当为“吴景贤”）2人作为监修或总撰写，致使隋唐史志中的记载纷歧致。丹波元胤按曰：“吴景贤名，见于《隋书·麦铁杖传》，则《概要》有吴景监撰之说者，实系臆测。然所以书为巢、吴同编，理似当然。姑据《新唐志》并载二家之书，以俟后考。”
据文献记载，《诸病源候论》一书在北宋曾经一直在撒播，如王焘的《外台秘要方》在每类别之前多先引《诸病源候论》之观念阐释疾病概念以及病因病机，后列但是诸方，在40卷《外台》中，有28卷341处引录了《诸病源候论》三十余卷中的文献，可见在王焘供职的弘文馆即藏有该书。而日本医家丹波康赖撰成于公元982年（相当于北宋太宗时）的《医心方》，亦仿《外台秘要方》之编制，于每门之前引录《病源论》（即《诸病源候论》）的“病候”内容，全书30卷中，有24卷直引《诸病源候论》五百四十余处，陆百四十余条，可见，在北宋之初，《诸病源候论》已撒播至日本。惋惜因为唐宋之间比年战乱，北宋曾经的传本均佚。
北宋政府对医学是比较注重的，其时曾颁令全国，向广阔的民间搜集各种但是的医方、单独、验方，购买和寻求献出医书。宋朝政府对此书极为注重，曾把它同《素问》《难经》《脉经》《千金翼方》《龙树论》等一同作为“医学”（宋代医学教育的专门组织）必读教材，一同规则，试补“医学”考试，也要从此书中选题，正缘于此，宋朝政府在建立“校对医书局”（此组织建立于北宋嘉祐二年，即公元1057年）之前，便把此书连同《素问》《难经》一同刊行于世。《玉海》卷六十三曰：“天圣四年（即公元1026年）十月十二日乙酉，命集贤校理晁宗慤、王举正校定《黄帝内经素问》《难经》《巢氏病源候论》；五年四月乙未，令国子监模印颁行，诏学士宋绶撰《病源》序。”此记叙与宋绶序文中所载彻底符合。是知宋代初刻此书的时刻是天圣五年（即公元1027年），早于建立“校对医书局”三十年。此刊本称为北宋本，但此本亦未保存下来。现存世的该书传本，是南宋今后的各种刊本。