明崇祯十七年(1644年)，李自成农人军攻入昌平，地上木构修建大部分被焚毁。同年清兵入关，陵寝再遭损坏。
清乾隆五十至五十二年(1785-1787年)修葺时，祾恩门、祾恩殿被缩小规制重建，但民国年间再次被焚。陵寝修建中只要宝城、明楼、重门和陵垣一直未遭严重损坏。
考古开掘
1956年-1957年我国考古工作者对地下玄宫进行了开掘，尔后有关部门又对出土文物进行修整，修葺地上古修建，公元1959年就旧址建为定陵博物馆。出土时，孝端皇后上盖缎被，尸身身下铺一床织金缎被，再往下有四层褥垫，其间一层褥垫上缀着100枚“消灾延寿”金钱。皇后头戴黑纱尖形棕帽，装修着金簪，上身穿绣龙方补黄绸夹衣，下身穿黄色缠枝莲花缎夹裤，足蹬黄缎鞋，腰间系着绣云龙纹长裙。神宗的棺椁内塞满了各种陪葬品，最上层盖的是织锦被，被下放着袍服和织饰匹料，尸身的下面垫着一条锦被，被下还有9层被褥，其间一件被褥上缀着17枚“吉祥满意”金钱。神宗头戴乌纱翼善冠，身穿刺绣衮服，腰系玉带，下身穿黄素绫裤，足蹬红素缎高绣靴。通过细心整理分类，共发现各种宝贵金器数百件，其间以帝、后的金冠最为精巧;各种袍料、匹料和服饰用品达600多件，尤以皇帝的缂丝十二章衮服龙袍和皇后的罗地洒线绣百子衣最为宝贵。
神宗头侧圆盒内的一顶金丝翼善冠，全用极细的金丝编织堆垒出二龙戏珠图画，孔眼细微而均匀，造型生动生动。如此繁复的制造，表面却不露一点点接头，体现出高明的手艺技艺。
皇后凤冠有三龙两凤冠、六龙三凤冠、九龙九凤冠、十二龙九凤冠。其间六龙三凤冠上六条龙均由金丝编织而成，绘声绘色，三只用翠鸟茸毛张贴的凤居下，似乎要破空而起。龙、凤口衔珠宝，在由珍珠宝石缀编的牡丹花、满意云、花树之间穿行。凤冠后的六扇博鬓左右分隔，珠光宝气，极端豪华，其上共装修红、蓝宝石128块，各种珍珠多达5400余颗。衮服龙袍是皇帝参与祭祀六合、宗庙、社稷等最为盛大的仪式时才穿的服装。缂丝十二章衮服的底纹上布满字图、寿字图、蝙蝠和满意祥云，涵义万寿洪福。前后身和两袖缂丝制造12个团龙，每个圆形的团龙周围饰有8种吉祥图画：法螺、法轮、宝伞、白盖、莲花、宝瓶、金鱼、盘长。别的繁复的十二章图样也全收其上，日、月、星斗、山、龙、华虫、宗彝、藻、火、粉米、黼、黻，标志王朝的控制，皇帝的文武兼备。编织龙袍所运用的缂丝技能也是十分共同的，但是这种技能到今天已是失传已久。史料记载，明朝初期开国皇帝朱元璋励精图治，日子节省，禁止缂丝制造服饰，由于缂丝工艺杂乱，本钱昂扬，娴熟织工一日只能完结一寸，制造一件长衣的缂丝面料需求接二连三编织10年之久。自明朝宣德年间开端，缂丝才在皇室豪华之风效果下重现人间，而神宗皇帝的衮服需求再加上孔雀羽、真金丝线等等工序，可谓绝代豪华。
罗地洒线绣百子衣出于孝靖皇后棺内，图画美丽，极富感染力，升龙、行龙左右环绕，龙身四周饰以云水，极端威严。在前后襟与衣袖上共绣有100个生动童子，姿势各异，或读书，或出游，或沐浴，不胜枚举。周围饰金银锭、方胜、古钱、犀角等八宝，还有以梅花、荷花、桃花、菊花、山茶等花卉组成的春、夏、秋、冬图画，包含“子孙万代，多福多寿”的涵义。
定陵地下宫廷出土了各类器物3000多件，其间有金器、银器、玉器、珠宝、金冠、凤冠、兖服、冕旒、百子衣等。明定陵的发现，为明史研讨供给了重要的什物材料，其地宫结构可谓明代皇陵规制的代表。
