但是，如中路三大殿等大面积宫殿的室内仍空空落落，历史上究竟应当是什么样子？内廷部分，在1951年前，乾清宫正殿内已经把南迁北返原有陈设品按原来遗留下来的位置陈设起来，这一处算是没有问题。坤宁宫怎么办？尤其西六宫，现在展示给观众的，是既没有历史意义也没有艺术价值的面貌。还有最重要的，观众参观故宫常常问皇帝住在哪里？故宫的工作人员必然答复是住在养心殿，但养心殿不开放。以当时养心殿的状况，如果不全面研究整理是无法开放的。1956年，吴院长将这个任务交给了朱家溍先生。朱家溍先生等根据“奏销档”等档案，对太和殿、坤宁宫、养心殿、储秀宫等几处宫殿的陈设进行了认真研究，列出了详细计划。经吴院长同意，储秀宫、长春宫按照光绪年间陈设档进行布置。翊坤宫、体元殿、太极殿，因上限相同，也一致进行。1959年，故宫博物院共完成重要展览13个，三大殿、交泰殿、坤宁宫实现原状陈列。
吴院长认为，倘若所有宫殿都进行原状陈列，不仅单调，而且观众在视觉上会有审美疲劳。在保和殿东庑、西庑设综合性的历代艺术馆，在东六宫开辟青铜馆、陶瓷馆、玉器馆、雕塑馆等专馆，在外东路筹建展示皇家庋藏和宫廷文物珍品的珍宝馆、钟表馆、绘画馆、铭刻馆等专题陈列，并整理开放了御花园、宁寿宫（乾隆）花园前部分以及一些佛堂，形成了宫廷原状陈列和专题陈列展览相辅相成、并驾齐驱的陈列体系，这一展陈理念和格局，得到了国内外专家学者和广大观众的赞同。
