尽管当时他并未得到朝廷的授命，但为解民所忧、急民之急，他果断决定出兵平定八寨及大藤峡。这个重大决定正是他“天泉证道”之后践行致良知心学思想的重要体现。
嘉靖七年（1528）四月，王阳明对八寨及大藤峡进行突袭并取得完美的胜利。他在《八寨断藤峡捷音疏》中对进剿过程进行了记述：
各贼先防湖兵经过，各将家属生畜驱入巢后大山潜伏；贼首胡缘二等各率徒党团结防拒。然访知本院住札南宁，寂无征剿消息，又不见调兵集粮，而湖兵之归，又皆偃旗息鼓，略无警备，遂皆怠弛，不以为意。
至是突遇官兵四面攻围，各贼仓惶失措，然犹恃其骁悍，蜂拥来敌。当有彭明辅、彭九霄、彭宗舜并头目田大有、彭辅等，督率目兵，奋不顾身，冲突矢石，敌杀数合，贼锋摧败。当阵生擒斩获首贼并次从贼徒、贼级六十九名颗，俘获男妇及夺回被虏人口、牛只、器械等项数多。
余贼退败，复据仙女大山，凭险结寨。各兵追围，攀木缘崖，设策仰攻至初四日，复破贼寨，当阵生擒斩获首贼并次从贼徒、贼级六十二名颗。初五日，复攻破油砟、石壁、大陂等巢，生擒斩获首贼及次从贼徒、贼级七十九名颗，俘获男妇、牛只、器械等项数多。
余贼奔至断藤峡、横石江边，因追兵紧急，争渡覆溺死者，约有六百余徒。官兵复从后奋勇追杀，当阵生擒获斩首贼及次从贼徒、贼级六十五名颗，俘获男妇、牛畜、器械等项数多。各贼间有一二漏网，亦皆奔窜他境。官兵追杀，至于本月初十日，遍搜山峒无遗。禀蒙收兵，回至浔州府住札间。随蒙本院密切牌谕，复令职等移兵进剿仙台等贼。
就于本月十一日夤夜仍前分布各哨官兵，遵照牌内方略，永顺于盘石、大黄江登岸，进剿仙台、花相等处;保靖于乌江口、丹竹埠登岸，进剿白竹、古陶、罗凤等处。刻定于十三日寅时一齐抵巢。各贼闻知牛肠等巢破灭，方怀疑惧，谋欲据险自固。贼首黄公豹、廖公田等各率徒党，沿途设伏埋签，合势出拒。官兵骤进，翕如风雨。
各贼虽已夺气，然犹舍死冲敌，比之牛肠等贼凶恶尤甚。各该官兵奋勇夹击，争先陷阵，生擒斩获首贼及次从贼徒、贼级四百九十名颗，俘获贼属男妇、牛畜、器械等项数多。
各贼奔入永安边界力山，恃险抗守。当蒙摘调指挥王良辅并目兵彭恺等于本月二十四日亦各分路并进，奋勇争先，四面仰攻。贼乃败散，当阵生擒斩获首贼及次从贼徒、贼级一百七十二名颗，俘获男妇、牛畜、器械数多。余贼远窜，追杀无遗。
王阳明当时心有感慨而写下了《破断藤峡》、《平八寨》二诗，诗为：
破断藤峡
才看干羽格苗夷，忽见风雷起战旗；
六月徂征非得已，一方流毒已多时。
迁宾玉石分须早，柳庆云霓怨莫迟；
嗟尔有司征往好，好将恩信抚遗黎。
平八寨
已说韩公破此峡，貔貅十万骑连山；
而今止用三千卒，遂尔收功一个月。
凯是人谋能妙称，偶邀天助及师还；
穷搜极讨非长策，须有恩成化梗顽。
民国三年《武宣县志》王阳明诗之载
此心光明复何言 仙城民众怀其恩
王阳明践行其“致良知”、“知行合一”思想，八寨断藤峡之战取得了决定性的胜利，但因此役当时并未得朝廷授命，桂萼上本参王阳明“征抚交失”，“萼遂显诋守仁征抚交失，赏格不行。议者乃言守仁受命征思、田，不受命征八寨。”嘉靖皇帝不但不给王阳明记功表彰，反而指责他“兵无节制，奏捷夸张。近日掩袭寨夷，恩威倒置。”
在饱受指责与非议之中，王阳明向朝廷上疏乞求告老还乡。因肺病加重，他不等朝廷的批复就返程回乡。
嘉靖七年十一月二十九日（1529年1月9日），王阳明病逝于归乡途中的江西南安府大庚县青龙港（今江西省大余县境内）舟中。临终之际，弟子问他有何遗言，他说：“此心光明，亦复何言！”
武宣地方官民对王阳明当年平定大藤峡之乱是心怀感恩的。清·嘉庆十三年（1808）《武宣县志》载：“断藤峡，......嘉靖间诸猺又据险为乱，王文成公守仁合师征之，至今安聀。”
