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南北朝末年，隋文帝杨坚发起灭陈之战，并派遣御史大夫杨素、御史元寿，任命行军总管李衍等人，分别于长江上游(今四川奉节东)、淮水流域和长江下游(今湖北襄阳)三地，建立造船场，监督战船制造。
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负责战船监造的御史杨素，批量建造了“五牙”楼船战舰至少4艘，定型10余种其它舰船种类，如斗舰、楼船、黄龙战舰、平乘、舴艋、轻艓等；御史元寿监造了远征高丽的海船300艘。这表明隋朝战船建造检验有了长足进步，在其种类、型制和结构方面，有了固定设计和质量检查规定，如《隋书》和《资治通鉴》都记载了“五牙”型制：五牙：上起楼五层，高百馀尺；左右前后置六拍竿，并高五十尺，容战士八百人。
公元589年，延州水战中，杨素水军乘四艘“五牙”舰，大破陈国水军，为推翻陈后主统治贡献了巨大力量。隋朝“五牙”战舰的船模，现陈列在北京军事博物馆的古代战争馆里。
隋朝“五牙”楼船战舰/网络
隋朝的国家管理机构实行“三省六部制”。工部下设水部司，掌舟船、津梁，公私水事，长官为水部侍郎。另外，舟船的建造和管理，还归司农部门的都水台下设的船局负责。
漕运管理体系延续曹魏政权的体制。三国时期魏国专门设置有管理漕运的监运谏议大夫一职，隋朝依然沿用。隋朝重视漕运事务的开展，还设置了舟楫署机构，掌船舶安全和公私漕运。署设令、丞各一人。管理各津口关卡的官吏称为舟楫尉。舟楫署的上级是都水监，公元603年都水监改为都水使者。
隋朝大运河未开通前，隋朝运往京城长安和陪都洛阳的漕粮需经激流凶险的黄河水道。公元605年，隋炀帝开通了宽十余丈、长800余里的大运河，连接五大水系，将隋朝北方的政治军事重心与南方经济重心联为一体，成为历代漕运要道。
公元605年、 615年和616年，隋炀帝沿大运河三下扬州。为了建立龙舟船队，隋炀帝派高官及相关人员去往江南大批量造船，这些相关人员，应是专业船只监造人员，包括“掌舟船”的水部官员和都水台下设的船局官员，负责船只建造的技术支持、业务管理、质量审核与登记等。
《资治通鉴》卷一百八十《隋纪四》：“龙舟四重，高四十五尺，长二百尺，上重有正殿、内殿、东西朝堂。中二重有百二十房，皆饰以金玉，下重内侍处之。”皇后乘翔螭舟，制度差小，而装饰无异。别有浮景九艘，三重，皆水殿也。又有漾彩、朱鸟、苍螭、白虎、玄武、飞羽、青凫、陵波、五楼、道场、玄坛、板翕、黄篾等数千艘，后宫、诸王、公主、百官、僧、尼、道士、蕃客乘之，及载内外百司供奉之物，共享挽船士八万馀人，其挽漾彩以上者九千馀人，谓之殿脚，皆以锦彩为袍。又有平乘、青龙、艨艟、艚艟、八棹、艇舸等……”。
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