徐闻县建置于西汉元鼎六年（公元前111年），属合浦郡，其县治、郡治都设在县西南海边讨网村（今五里乡二桥村）。汉代，县署设县令，下设县丞、县尉。
唐贞观二年（628年），徐闻县署由讨网村迁麻鞋村（今五里乡芒海村）。唐、宋代，县署组织沿汉制。
元至元二十八年（1291年），徐闻县署迁宾朴村（今徐乡镇城内）。县署设县令，下设县尹、县丞、县尉、主簿、典史等。
明天顺六年（1462年），徐闻县署迁海安。明弘治十四年（1501年），县署迁返宾朴原址。
明初，徐闻县署设知县，总揽全县行政、司法、税收大权。知县下设县丞、主簿、典史等佐理人员，分掌粮马、巡捕、文书、出纳等业务。明洪武三年（1370年），设东场巡检司（驻东场）、宁海巡检司（驻海安）专管缉拿、治安业务。
清代，徐闻县署设知县为行政长官，下设县丞、典史、教谕、训导、巡检、驿丞等佐理人员。县丞掌管粮马纳税，典史掌管户籍、巡捕、督查、狱囚，教谕，训导掌管校园生徒，巡检掌管缉拿伏莽，驿丞掌管邮传迎送。县署分科就事，分设吏房、户房、兵房、刑房、工房、仓房、仓库等。雍正七年（1729年），《广东通志》记载：县行政组织设有县署、教谕、训导、典史、宁海巡检司（雍正十二年移驻曲界圩）、东场巡检司（雍正十二年移驻迈陈圩）；行署设有海北道、布政分司、第宅。光绪三十三年（1907年）起，实施新官制，知县下设警长1人，掌管户籍、巡警、消防、营缮、卫生；视学员1人，掌管教育；勤业员1人，掌管农、工、商及交通；典狱员1人，掌管监狱；主计员1人，掌管财政税收业务。
