清廉之士遇上贪财之官，只用了不到一年的时间，后者就招架不住。一到任上，王恕就开始了全面调查，掌握了大量证据。得知天下有名的清廉能臣来了云南，包括沐王府在内的许多人都十分高兴，积极协助，这让钱能更加恐惧。可是皇帝还是放过了钱能。此后，王恕调到南京为官。
在当时来说，南京距离北京遥远，此地官员贪腐之风远胜于北京。不过王恕一来，局面就大不相同。王恕在自己的职责范围内，绝不容许有贪腐之事。对于同僚所管事务，也时时监督。南京百姓感叹终于来了一位清官，称“两京十二部，独有一王恕”。王恕晚年在家乡向皇帝上书，对很多重要的朝政提出了自己的建议，明武宗诚恳接纳，并厚赏了王恕。
王恕身为明朝的清官，在食量方面倒是很厉害。《古今笑史》记载：“王端毅公恕，年九十余，每辰起进食，牛羊犬豕肉或鸡凫之类三十碗……”这段话的意思就是王恕九十多岁的时候，仍然可以吃下牛、羊、猪、狗肉鸡鸭肉三十碗，一大碗蔬菜，两盘面饼，还能喝下三大碗清酒。虽然王恕最终告老还乡，但是王恕的后代仍然保持了清廉勤俭的德行。他的儿子王承裕，自幼蒙受父训，二十九岁考中进士。为官之后，主动退还了朝廷赏赐给王家的田产。
