这是一个好问题，的确，现在的很多古代遗址都是掩埋在地下的，有的比较浅一些，挖掉表层的耕作土壤就能暴露出来，有的则很深，甚至在地下十几米处才能找到。比如著名的“开封城，城摞城”，在今天的开封城下，还掩埋着东周到明清时期的开封城，最深处有十几米，目前还无法进行发掘。很多朋友就会有疑问了，为啥这些遗址都会慢慢地被埋在地下呢？
一般来说，文化层形成的顺序是自下而上一层一层的进行堆积，下层的年代要早于上层的年代。也就是说，年代越早的文化层，距离今天的地表越深，年代越晚的文化层，则距今天的地表越近。之所以出现这种情况，总的来看，是由于各种原因导致人工建筑的倒塌或废弃后，人为垫土、填埋，以及自然界的风力沉积，甚至于间歇性的洪水泛滥等，造成了新的土层叠压在废弃物上。如此一代一代，成百上千年之后，原来的古城或者遗迹，自然就被埋在很深的地下。
我们发现的很多古建筑遗址，包括一些古老的城市，很多也是在地下的。其实这个并不奇怪，我们发现的这些建筑遗址，比如大明宫等，其实挖掘出来，展现在我们面前的，都是地基，而不是完整的建筑。我们修房子，都在把地基打在地下，埋得越深，地基就会越牢固，而露出在地面上的那些墙壁、屋顶等，因为时间流转，或者人为的破坏，没有被保存下来，但只要不是在原地再次修房，人们都不会去把地下的地基挖出来。再加上开长日久，一代又一代的人不停地在上面挖掘或者填土，最终让地基深埋在地下。
战争是最具有毁灭性的，数千年来战火不休，每一次战火，都可能让城市化为一片焦土。或者产生大量的灾民难民。饥荒，瘟疫，也会让大量人抛弃家园流离失所。他们离去之后，原有的建筑倒塌风化雨水冲刷，被埋在土里。等新的居民来到的时候，直接在上面建造，形成新的城市。