但是，最终吴三桂还是起兵反叛了，这个时候，身为一方掌权者的朱国治也被吴三桂要求加入反叛的阵营。但是，此时的朱国治却是强烈的拒绝了，因为，他的心中还是忠于大清的，正在他劝吴三桂投降不要造反时，却被吴三桂一怒之下杀掉祭旗以鼓舞全军的士气，史料记载“开膛枭示”。甚至，连尸首都被当时守在一旁的士兵分着食用了，最终，落得这般命运也是让人唏嘘不已。
看朱国治的一生，虽然，他为了自己的私利鱼肉百姓贪污了很多银两，但是，对于朝廷来说他是忠诚的，最后一刻也没有忘记自己的底线，或许，这就是影视剧给他一个正面形象的原因吧。
并且，在他死后，皇帝考虑良久还是把他列入了满清烈士的行列，也算是肯定他最后能坚持住底线，没有意图叛国，即使，他做了那么多贪赃枉法的事情，也没有让他背负太多的骂名。甚至，清廷为其著书立传，一而再、再而三地向全天下宣传他的事迹，将其上升到了忠良楷模的高度。
清廷在平叛战争结束后，没收藩产入官充当军饷，撤藩回京师。除吴三桂部调往边区站、台服役外，其余各部重新编入八旗。福州、广州、荆州派八旗兵驻防，广西、云南派绿营兵镇守，彻底消除了藩镇制。
其实，影视剧在改编的过程中给予他正面镜头的原因还是想塑造其一个大义的形象，以此，给大众起到一个示范作用。
参考资料：
『《甲申朝事小纪》、《滇事总录》、《清史稿》』
