代善的红旗，也分红正红、镶红两旗，由代善和代善的儿子们统领(代善的儿子岳托和硕托均是镶红旗的小旗主)。
原蓝旗的旗主阿敏，成为镶蓝旗旗主，属人没有改变。
正蓝旗的旗主则由努尔哈赤的第五子莽古尔泰担任。别的，莽古尔泰的亲弟弟德格类担任小旗主。
正白旗旗主不变，仍由皇太极担任。
镶白旗旗主由原正白旗小旗主杜度担任，一同努尔哈赤把自己的第七子阿巴泰也塞进了镶白旗，与杜度一同组成了镶白旗(阿巴泰是小旗主)。
这儿额定插一句，其时的八旗的旗子，应该是没有图画的，也便是一面只要色彩的旗号。四镶旗是在旗子中心加一条龙。咱们今日看到的这种八旗旗子的款式，是公元1622年之后才确认的款式。
这个时期的八旗旗主别离是：两黄旗——努尔哈赤;两红旗——代善，岳托、硕托(小旗主);正白旗——皇太极;镶白旗——杜度，阿巴泰(小旗主);正蓝旗——莽古尔泰，德格类(小旗主);镶蓝旗——阿敏;
努尔哈赤晚期的八旗变化
后金天命八年(公元1623年)，努尔哈赤依照女真人“嫡长子承继皇位，嫡幼子承继产业”的传统。将自己的三个嫡幼子：18岁的阿济格、11岁的多尔衮、9岁的多铎，归入自己亲身统领的两黄旗，并将两黄旗拆分，别离封给他们，使他们成为小旗主。
其时努尔哈赤的两黄旗总共有60个佐领，他把正黄旗的15个佐领封给阿济格，别的15个佐领封给多尔衮。再从镶黄旗分出15个佐领封给幼子多铎，剩余的15个镶黄旗佐领由他亲身统领。
然后努尔哈赤立下遗言，等他逝世后，他自己统领的15个镶黄旗佐领，也交给多铎承继。相当于便是说，阿济格为正黄旗旗主，多铎为镶黄旗旗主;多尔衮没有方位，所以努尔哈赤把镶白旗旗主杜度调到镶红旗，好让多尔衮承继镶白旗。
成果这次调集还没有完结，努尔哈赤就忽然死了。皇太极瞅准时机，敏捷让儿子豪格抢占了没有旗主的镶白旗。这一下，皇太极父子就抢到了两白旗。
这儿额定插一句，这次分封后，由于正黄旗分给了阿济格和多尔衮，镶黄旗成了努尔哈赤仅有亲领的旗。因而镶黄旗就变成了八旗的头旗。很多人常常问，八旗之首是哪个旗?看到这儿应该就知道了——是镶黄旗。
皇太极时期的八旗变化
努尔哈赤身后，皇太极继位。这位新任大汗是个狠人物，为了镇压不服他的人，皇太极对八旗进行了三次大的调整。
第一次调整——两黄旗和两白旗交换。
这次调旗很简单，便是皇太极的正白旗、豪格的镶白旗和阿济格、多尔衮、多铎的两黄旗对调。由于皇太极是后金大汗，他以为黄旗只要大汗才配运用。所以，承继了汗位的皇太极就逼着多尔衮三兄弟与自己对调了旗色，以显示自己的“正统性”。
需求阐明的是，这次调整只换旗色，也便是两白旗换两黄旗，服装色彩对调;两黄旗换两白旗，服装色彩对调。而旗主之下的隶属人员没有进行变化。
第2次调整——镶蓝旗旗主换人。
永平之战后，阿敏(舒尔哈齐的次子)逃回关外，皇太极借此刻机整肃阿敏。他招集众大臣及贝勒，给阿敏定了议十六项大罪。终究处理成果是：削去阿敏的旗主之位，并将其圈禁在家。其所属镶蓝旗则赏给跟皇太极穿一条裤子的堂弟济尔哈朗。
由于济尔哈朗也是舒尔哈齐的儿子，这次换旗主，镶蓝旗没什么异动。
第三次调整——两黄旗和正蓝旗的混编。
后金天聪六年(公元1632年)，正蓝旗的旗主莽古尔泰病逝，正蓝旗的旗主由原先正蓝旗小旗主莽德格类承继，而莽古尔泰的佐领也由莽古尔泰的儿子承继(小旗主)。
后金天聪九年(公元1635年)，正蓝旗的旗主德格类病死，同年有人揭发莽古尔泰、德格类一门谋反。皇太极趁此刻机将莽古尔泰和德格类一门掠夺旗权，趁便将正蓝旗没收为己。所以正蓝旗就被皇太极给吞并了。
