万贵妃
次子朱祐极夭折之后，三子朱祐樘就成了长子。种种迹象表明，朱见深并不喜欢朱祐樘，从朱祐樘的母亲纪氏的待遇上就能看出这点：1.纪氏生下儿子，却不能母凭子贵，其待遇和普通妃嫔一样；2.即便朱祐樘于成化十一年（1475年）被封为太子时，纪氏除搬到永寿宫居住之外，并没有得到其他封赏。直到纪氏去世之后，朱见深才追封她为淑妃。只是，朱见深不喜欢的这个儿子却已经是他的长子，足以影响到太子之位。
所以，我认为朱见深不向外廷公开朱祐樘的存在，其目的就是不希望立朱祐樘为太子。他的想法应该是，即便万贵妃不能生下儿子的话，只要有其他妃子生下儿子，都可以把这个儿子过继给万贵妃抚养，再立为太子。这也符合《皇明史窃》的说法“上为万贵妃特秘之”。
汪直
那么，朱见深为什么不希望朱祐樘当太子呢？我认为原因可能有两个：1.纪氏非汉人血统，纪氏是广西瑶族人，是成化元年明朝平定大藤峡叛乱时俘虏入宫的；2.纪氏本身也不讨朱见深喜欢。考虑到成化六年前后朱见深对万贵妃的专宠，朱见深可能只是临时起意，宠幸了纪氏，生下了朱祐樘。也就是说，朱祐樘其实是朱见深不经意间留下的种子，自然得不到朱见深的喜爱。
遗憾的是，从成化八年（1472年）到成化十一年（1475年）这三年中，朱见深并没有妃子怀孕。皇储问题关乎国本，太子空悬太久，朝中群臣心急如焚。朱见深虽向朝廷群臣隐瞒了朱祐樘的存在，但内廷中知道此事的人应该不少，时间长了，外廷官员逐渐也知道朱祐樘的存在。
汪直
在内阁首辅商辂的主持下，朱见深只能将朱祐樘认祖归宗，并昭告天下。商辂洞察了朱见深不想立太子的意图，上《国本疏》说：“皇子的母亲因病住其他地方，太久不能与皇子相见。希望能够让皇子的母亲在附近居住，皇子仍由贵妃抚养，但方便母子见面，以全母子之情。”商辂知道自己主持立朱祐樘为太子，忤逆了朱见深的意思，于是先只能主动提出由万贵妃抚养朱祐樘，遂了朱见深的心意，以弥补朱见深心中的不快，足见商辂这人做事很圆滑。同时，在商辂的主持下，纪氏得以移居永寿宫。商辂《国本疏》：重以贵妃殿下躬亲抚育，保护之勤，恩爱之厚，逾于巳出。凡内外群臣以及都城士庶之门闻之，莫不交口称赞，以为贵妃之贤，近代无比，此诚宗社无疆之福也。但外间皆谓，皇子之母因病另居，久不得见，揆之人情事体诚为未顺。伏望皇上勅令就近居住，皇子仍烦贵妃抚育，俾朝夕之间便于接见，庶得以遂母子之至情，惬众人之公论，不胜幸甚。
商辂像
只是没想到的是，纪氏移居永寿宫一个多月以后病逝了，舆论哗然，事情太凑巧，一些大臣猜测与万贵妃有关。只是没有任何证据，再者纪氏在西宫时已经病重，朱见深宠爱万贵妃却不喜欢纪氏，此事最终也只能不了了之。出于安全方面的考虑，商辂再次上奏，请求让周太后抚养朱祐樘，纪氏之死万贵妃本身就说不清，朱见深也只能同意。
成化十一年（1475年）九月，商辂与群臣再次奏请立朱祐樘为太子，朱见深最终同意，并于成化十一年（1475年）十一月正式下诏册封。
