孙承宗构筑的这个防御体系，所以能发挥重大作用，有以下方面的原因：
第一、善择将领，组成有效的指挥体系。
他把选将用将看作是恢复辽东的关键。经奏准，对王在晋、闫鸣泰等人的进退去留作了调整，同时裁撤了一批庸官逃将，晋升了一批能真心任事、以守关复辽为已任的将领，其中有袁崇焕、鹿善继、马世龙、尤世禄等。此外，还广揽天下贤才。
孙承宗属下的将吏都有明确分工，做到各司其职。他以职方主事鹿善继、王则古辅佐谋划军事；总兵江应诏定兵制；佥事袁崇焕建军营；李秉诚炼火器，沈棨、杜应芳储备武器；司务孙元化筑炮台；中书舍人宋献、羽林经历程仑主市马，广宁道佥事万有孚主采木；游击鲁之甲拯难民；副将李成先练骑卒，参将杨应乾募辽人为军。指挥系统设大将军，以马世龙为平辽将军，王世钦、尤世禄为南北部将。这些将吏在不同的岗位上，都做出了优异的成绩。例如，鹿善继治军储，保证了前线粮饷的供给，江应诏定兵制，使5人为1房，3000人为1营，15营为3部，做到兵不离将，将不离帅，健全了军队编制，增强了战斗力。
第二、因地制宜部署兵力，组建车营。
孙承宗针对从宁前到关内不同的地理情况，精心部署兵力。在重点设防地区山海关，海上从望海台出芝麻湾的海口，配备大炮，拦击从海上入侵之敌。陆上在三道关的石城驻扎1万人,以便适时突袭敌人。北水关外筑台堡11座，安设大炮。山海关正面，以3000人守中后所，3000人守中右所(今沙后所)，并遣精骑出哨中右，使关之正面和左右翼互相声援,以利固守。平辽将军马世龙节制三部，南北部将王世钦、尤世禄分驻海口、角山,中部由中军节制，驻罗城；副将赵率教、孙谏为前后部统将，分驻前屯和红花店，合计7.5万人。
在宁、锦前线，除以重兵驻宁、锦外，还遣军进驻金、复、海、盖四卫，四卫之后尾旅顺由毛文龙守御。在海上,除觉华岛外，又以天津、登、莱水师作预备队，随时声援辽宁半岛之四卫。此外，还借助朝鲜兵力从侧面声援。
山海关以内，永平府设总兵，卢龙、蓟门等州县设守将，添兵防守，做到镇戍连结，墩营相望。其他州县也有重点位置设防，既可作为山海关前线的老营，又可组成机动部队速援京师。
以上兵力部署，既可造成“东连西结”的有利态势，又能置后金于被包围的地位。
孙承宗还根据“敌长弓矢，我利火炮”的特点，大量制造和使用火器，组建车营。他从宣府、大同等7镇抽调精锐1.2万人赴山海关前线，组建12个车营，制定《车营练阵规条》，令官兵熟读牢记，学会实际运用。这12车营成为阻挡后金八旗兵的一支重要力量。
第三、依靠民众，推行“以辽人守辽土，以辽土养辽人”的政策。
孙承宗把这一政策称为守关“大计”和“复辽之资。他把流入关内的辽人安置到各卫所进行屯田；对关上之辽人，体强有武艺者分别安置在中、前二屯及宁远一线各堡寨，充实守备力量，并把他们的家属组织起来,从事屯种；对关外13站一带的十几万辽人，也按强者为兵、弱者屯牧的方法妥善安置。这样，就实现了军民一体，同守边关。
四、因敌用兵，巧施谋略
崇祯二年至三年间，后金的八旗兵绕过山海关防线，先后占领了遵化、滦州、迁安、永平四城，直接威胁明京师的安全。孙承宗第二次督师蓟辽时，决心拔掉这四颗钉子。崇祯三年秋，他调集山西总兵马世龙,锦州总兵祖大寿，山东总兵杨绍基，副将祖大乐、祖可法、张弘谟等军先攻滦州。驻永平的大贝勒阿敏、硕托得知滦州被围,即派大臣巴部礼率兵驰援，结果被明军歼灭。明军以炮攻城，城内的纳穆泰、汤古岱力支持不住，于十二月放弃滦州，逃奔永平。阿敏等因滦州失守，惶恐不安，便率部弃城经冷口逃回沈阳。数天之内，四城尽复，明朝称之为“遵永大捷”。
这次作战的胜利，首先归功于孙承宗对敌情的正确分析和采取灵活的战法。
