明清对于宰相又进行了一系列改革。
明朝洪武十三年，撤销中书省及左右丞相，平章政事等官职，废除秦汉以来的宰相，由皇帝直接处理一切政务，只从翰林院等文翰机关选调官员加殿阁大学土衔，辅助皇帝阅看奏章，处理文节，以及根据皇帝旨意草拟诏谕等，并且作为皇帝的顾问，但“不得平章国事”。英宗以后，内阁大学士权势渐重，虽无宰相之名，却有宰相之实。首席大学士习惯上称为“首辅”或“首揆”。
嘉靖、隆庆和万历初期，首辅、次辅界限严格，首辅职权最重，主持内阁大政，次辅不敢与之比较。英宗初年，杨土奇任华盖殿大学士，杨荣任文渊阁大学士，杨溥任武英殿大学士共同辅政，并称“三杨”。嘉靖年间，夏言，严嵩、徐阶先后以首辅执政。隆庆至万历初年，张居正为首辅，主持国政十年，针对当时弊政，进行了一系列重要改革。
清朝雍正时设立军机处，内阁大学士的职权逐渐被军机大臣所替代，不过，军机大臣之资望特重者，仍授予大学士，做为荣典。有不少大臣以内阁大学士兼军机大臣，如尹继善、刘统勋，庆桂、舒赫德，梁国治、那彦成、长龄等。军机大臣也成为事实上的宰相。
总结：宰相，作为一种制度，是随着国家的出现而一起产生的。是古代帝王之下的最高官职。秦始皇为巩固统治，颁布了一系列旨在加强中央集权的政策措施，其中包括设置丞相，明朝废丞相、设六部，是为了加强中央集权，唐朝是用增加丞相的方式来削弱每个丞相的权力， 到明清废除宰相制其最终目的就是——加强皇权。
