隋唐时期是我国历史上一个重要的历史时期，不光是因为后来盛唐的荣耀，更多的是因为在隋朝末年涌现出一批十分优秀、家喻户晓的英雄人物，这些英雄人物就像天上的繁星一样，在广阔无垠的天空上留下了自己的光芒。秦琼绝对是那些光芒四射的星星中的一颗，而喜欢看《隋唐演义》类小说的朋友们一定会认为秦琼也是瓦岗军的创始人之一，然而，真实的历史却并非如此。建立瓦岗军的人名叫翟让，原本是隋朝的官员，因为犯下错误就要被处斩了，他抱着横竖都是一死，不如搏一搏的心态，占领了瓦岗寨当起了山大王。单雄信和徐世绩都是翟让的好朋友，听说翟让占山为王之后，也带领手下去投奔翟让了，就这样最初的瓦岗军雏形建立起来了。
因为翟让当时只是想当一个山大王而已，并没有什么起兵反隋，建立王朝的野心，所以当时的瓦岗军不过是一群乌合之众而已，。然而，因为隋朝大失民心，时局又混乱，瓦岗军居然发展到了一万多人的规模，这趋势挡都挡不住。只不过，这个时候的瓦岗军虽然规模已经较大了，但是没有明确的政治纲领，依然还只是土匪军而已。
直到一个人的出现，瓦岗军才算是真正有了灵魂，他就是——李密。李密出身高 贵，他的父辈是当时极为显赫的关陇贵族，名叫李弼；李密一直很努力，却得不到隋炀帝的重用，于是他一赌气就加入瓦岗寨。李密是一个很有战略眼光的人才，所以他的加入让瓦岗军焕然一新，瓦岗军的实力也因此不断壮大。后来发展到让皇帝不得不派兵剿灭的地步。当时皇帝派出的将军名叫张须陀，而秦琼就是他手下的一员虎将。
秦琼字叔宝，今天山东济南人氏，在帮助张须陀剿灭隋朝叛军卢明月的战争中，秦琼表现十分出色，他与罗士信合作，居然用一千兵战胜了卢明月的一万兵，所以深受张须陀的喜欢。张须陀因为之前和翟让的军队有过几次交锋，所以对于这次战争是十分不屑的，然而骄兵必败，李密就通过这点设计打败了张须陀，并且杀死了他。秦琼靠着自己武功高强，左冲右突杀出重围。逃脱之后的秦琼投靠了隋朝的另一位将军裴仁基。《新唐书.秦琼传》记载的原文是：
裴元庆
裴仁基就是《隋唐演义》里第三条好汉裴元庆的父亲，秦琼投靠裴仁基后不久，裴仁基也领命去攻打瓦岗寨。本来裴仁基是准备剿灭瓦岗寨建功立业的，可是他军队中的监军御史萧怀静与他不合，萧怀静想办法搜罗裴仁基的所谓罪行向朝廷告状，而李密利用这个机会趁机对他策反，于是裴仁基投靠了瓦岗寨。秦琼也追随着他投靠了瓦岗，至此秦琼才终于成为了瓦岗军的一员。因为他在之前战争中的勇猛表现，所以到了瓦岗之后就得到了重用。