钟离成了南梁淮河防线上的最后一个据点。萧衍深知钟离保卫战的重要性，考虑到前线梁军处于绝对劣势，萧衍派将军曹景宗率军二十万从建康救援钟离，又下令驻守合肥的韦叡前往增援。
507年二月，韦曹二部在钟离城下会师。此时，魏军已经围攻钟离城四个多月了。南梁能够守住，一方面要归功于梁军将士的英勇，杀得魏军的尸体堆得差不多和城墙一般高；另一方面要归功于这段时间淮河流域断断续续在下雨，淮河和雨水将钟离城罩上了一道天然的屏障。
韦睿来到钟离城下后，指挥部队迅速登陆邵阳洲，逼近魏军营垒，连夜挖长沟、搭鹿角，造了一座甲明枪亮的梁军大营。第二天，元英醒来，发现眼前出现了一座敌军营垒。他改变计划，决定先消灭梁朝援军，再攻钟离城。元英派出猛将杨大眼率领铁骑杀向韦叡的部队。韦叡学习刘裕，采取战车阵，将两千辆战车结集在外围，并在每辆车上都安排了一支强弩。杨大眼的骑兵一靠近，梁军强弩连发，杀得魏军人仰马翻。
几天后，淮水水位降水暴涨。梁军出动水师沿淮而上。梁军的大船体积巨大，和营垒一般高，里面载满武士，同时又有许多小船，里面装满干草浇油，准备火攻。魏军在淮河两岸都扎下营垒，以淮河中的邵阳洲为支点，南北各搭建桥梁相连接。梁军放火烧桥，火借风势，迅速蔓延到邵阳洲和两岸的魏军营垒。被分割为几段的魏军陷入火海之中，梁军士兵又下船登陆，猛杀狂砍。魏军乱成一团，桥梁和营垒塌毁，官兵四散而逃。烧死、淹死、踩死、砍死的魏军超过了二十万人，主帅元英单骑逃往梁城。
钟离保卫战以梁朝完胜告终。这是继刘裕北伐告捷之后，南朝又一场辉煌的胜利。同时，钟离之败是北魏对南朝作战以来前所未来的惨败。虽然没有像淝水之战一样引发北魏的崩溃，却也造成魏军精锐损失大半。帝国元气大伤，朝野哗然。元英因为损兵折将，萧宝夤因为支援不力，按律当斩。考虑到二人之前的军功，赦免死罪，双双削爵罢官为民。
